src/uk/ac/ebi/www/picr/AccessionMappingService/AccessionMapperInterface.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package uk.ac.ebi.www.picr.AccessionMappingService;\r
  20 \r
  21 public interface AccessionMapperInterface extends java.rmi.Remote\r
  22 {\r
  23   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry getUPIForSequence(\r
  24           java.lang.String sequence, java.lang.String[] searchDatabases,\r
  25           java.lang.String taxonId, boolean onlyActive)\r
  26           throws java.rmi.RemoteException;\r
  27 \r
  28   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[] getUPIForAccession(\r
  29           java.lang.String accession, java.lang.String ac_version,\r
  30           java.lang.String[] searchDatabases, java.lang.String taxonId,\r
  31           boolean onlyActive) throws java.rmi.RemoteException;\r
  32 \r
  33   public java.lang.String[] getMappedDatabaseNames()\r
  34           throws java.rmi.RemoteException;\r
  35 }\r