src/uk/ac/vamsas/objects/core/descriptors/AlignmentAnnotationDescriptor.java

   1 /*\r
   2  * This class was automatically generated with \r
   3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
   4  * Schema.\r
   5  * $Id$\r
   6  */\r
   7 \r
   8 package uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors;\r
   9 \r
  10   //---------------------------------/\r
  11  //- Imported classes and packages -/\r
  12 //---------------------------------/\r
  13 \r
  14 import uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation;\r
  15 \r
  16 /**\r
  17  * Class AlignmentAnnotationDescriptor.\r
  18  * \r
  19  * @version $Revision$ $Date$\r
  20  */\r
  21 public class AlignmentAnnotationDescriptor extends uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor {\r
  22 \r
  23 \r
  24       //--------------------------/\r
  25      //- Class/Member Variables -/\r
  26     //--------------------------/\r
  27 \r
  28     /**\r
  29      * Field _elementDefinition.\r
  30      */\r
  31     private boolean _elementDefinition;\r
  32 \r
  33     /**\r
  34      * Field _nsPrefix.\r
  35      */\r
  36     private java.lang.String _nsPrefix;\r
  37 \r
  38     /**\r
  39      * Field _nsURI.\r
  40      */\r
  41     private java.lang.String _nsURI;\r
  42 \r
  43     /**\r
  44      * Field _xmlName.\r
  45      */\r
  46     private java.lang.String _xmlName;\r
  47 \r
  48     /**\r
  49      * Field _identity.\r
  50      */\r
  51     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor _identity;\r
  52 \r
  53 \r
  54       //----------------/\r
  55      //- Constructors -/\r
  56     //----------------/\r
  57 \r
  58     public AlignmentAnnotationDescriptor() {\r
  59         super();\r
  60         setExtendsWithoutFlatten(new uk.ac.vamsas.objects.core.descriptors.RangeAnnotationDescriptor());\r
  61         _nsURI = "http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes";\r
  62         _xmlName = "AlignmentAnnotation";\r
  63         _elementDefinition = true;\r
  64         \r
  65         //-- set grouping compositor\r
  66         setCompositorAsSequence();\r
  67         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
  68         org.exolab.castor.mapping.FieldHandler             handler        = null;\r
  69         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
  70         //-- initialize attribute descriptors\r
  71         \r
  72         //-- _graph\r
  73         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Boolean.TYPE, "_graph", "graph", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
  74         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
  75             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
  76                 throws IllegalStateException\r
  77             {\r
  78                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
  79                 if (!target.hasGraph()) { return null; }\r
  80                 return (target.getGraph() ? java.lang.Boolean.TRUE : java.lang.Boolean.FALSE);\r
  81             }\r
  82             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
  83                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
  84             {\r
  85                 try {\r
  86                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
  87                     // ignore null values for non optional primitives\r
  88                     if (value == null) { return; }\r
  89                     \r
  90                     target.setGraph( ((java.lang.Boolean) value).booleanValue());\r
  91                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
  92                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
  93                 }\r
  94             }\r
  95             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
  96                 return null;\r
  97             }\r
  98         };\r
  99         desc.setHandler(handler);\r
 100         desc.setRequired(true);\r
 101         desc.setMultivalued(false);\r
 102         addFieldDescriptor(desc);\r
 103         \r
 104         //-- validation code for: _graph\r
 105         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 106         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 107         { //-- local scope\r
 108             org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator typeValidator;\r
 109             typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.BooleanValidator();\r
 110             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 111         }\r
 112         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 113         //-- _seqrefs\r
 114         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Object.class, "_seqrefs", "seqrefs", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
 115         desc.setReference(true);\r
 116         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 117             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 118                 throws IllegalStateException\r
 119             {\r
 120                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 121                 return target.getSeqrefs();\r
 122             }\r
 123             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 124                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 125             {\r
 126                 try {\r
 127                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 128                     target.addSeqrefs( (java.lang.Object) value);\r
 129                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 130                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 131                 }\r
 132             }\r
 133             public void resetValue(Object object) throws IllegalStateException, IllegalArgumentException {\r
 134                 try {\r
 135                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 136                     target.removeAllSeqrefs();\r
 137                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 138                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 139                 }\r
 140             }\r
 141             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 142                 return new java.lang.Object();\r
 143             }\r
 144         };\r
 145         desc.setMultivalued(true);\r
 146         desc.setHandler(handler);\r
 147         desc.setMultivalued(true);\r
 148         addFieldDescriptor(desc);\r
 149         \r
 150         //-- validation code for: _seqrefs\r
 151         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 152         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
 153         { //-- local scope\r
 154             org.exolab.castor.xml.validators.IdRefsValidator typeValidator = new org.exolab.castor.xml.validators.IdRefsValidator();\r
 155             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
 156             desc.setValidator(fieldValidator);\r
 157         }\r
 158         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 159         //-- initialize element descriptors\r
 160         \r
 161         //-- _provenance\r
 162         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
 163         handler = new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
 164             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
 165                 throws IllegalStateException\r
 166             {\r
 167                 AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 168                 return target.getProvenance();\r
 169             }\r
 170             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
 171                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
 172             {\r
 173                 try {\r
 174                     AlignmentAnnotation target = (AlignmentAnnotation) object;\r
 175                     target.setProvenance( (uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
 176                 } catch (java.lang.Exception ex) {\r
 177                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
 178                 }\r
 179             }\r
 180             public java.lang.Object newInstance(java.lang.Object parent) {\r
 181                 return new uk.ac.vamsas.objects.core.Provenance();\r
 182             }\r
 183         };\r
 184         desc.setHandler(handler);\r
 185         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.ac.uk/schemas/1.0/vamsasTypes");\r
 186         desc.setRequired(true);\r
 187         desc.setMultivalued(false);\r
 188         addFieldDescriptor(desc);\r
 189         \r
 190         //-- validation code for: _provenance\r
 191         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
 192         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
 193         { //-- local scope\r
 194         }\r
 195         desc.setValidator(fieldValidator);\r
 196     }\r
 197 \r
 198 \r
 199       //-----------/\r
 200      //- Methods -/\r
 201     //-----------/\r
 202 \r
 203     /**\r
 204      * Method getAccessMode.\r
 205      * \r
 206      * @return the access mode specified for this class.\r
 207      */\r
 208     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode(\r
 209     ) {\r
 210         return null;\r
 211     }\r
 212 \r
 213     /**\r
 214      * Method getIdentity.\r
 215      * \r
 216      * @return the identity field, null if this class has no\r
 217      * identity.\r
 218      */\r
 219     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity(\r
 220     ) {\r
 221         if (_identity == null) {\r
 222             return super.getIdentity();\r
 223         }\r
 224         return _identity;\r
 225     }\r
 226 \r
 227     /**\r
 228      * Method getJavaClass.\r
 229      * \r
 230      * @return the Java class represented by this descriptor.\r
 231      */\r
 232     public java.lang.Class getJavaClass(\r
 233     ) {\r
 234         return uk.ac.vamsas.objects.core.AlignmentAnnotation.class;\r
 235     }\r
 236 \r
 237     /**\r
 238      * Method getNameSpacePrefix.\r
 239      * \r
 240      * @return the namespace prefix to use when marshaling as XML.\r
 241      */\r
 242     public java.lang.String getNameSpacePrefix(\r
 243     ) {\r
 244         return _nsPrefix;\r
 245     }\r
 246 \r
 247     /**\r
 248      * Method getNameSpaceURI.\r
 249      * \r
 250      * @return the namespace URI used when marshaling and\r
 251      * unmarshaling as XML.\r
 252      */\r
 253     public java.lang.String getNameSpaceURI(\r
 254     ) {\r
 255         return _nsURI;\r
 256     }\r
 257 \r
 258     /**\r
 259      * Method getValidator.\r
 260      * \r
 261      * @return a specific validator for the class described by this\r
 262      * ClassDescriptor.\r
 263      */\r
 264     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator(\r
 265     ) {\r
 266         return this;\r
 267     }\r
 268 \r
 269     /**\r
 270      * Method getXMLName.\r
 271      * \r
 272      * @return the XML Name for the Class being described.\r
 273      */\r
 274     public java.lang.String getXMLName(\r
 275     ) {\r
 276         return _xmlName;\r
 277     }\r
 278 \r
 279     /**\r
 280      * Method isElementDefinition.\r
 281      * \r
 282      * @return true if XML schema definition of this Class is that\r
 283      * of a global\r
 284      * element or element with anonymous type definition.\r
 285      */\r
 286     public boolean isElementDefinition(\r
 287     ) {\r
 288         return _elementDefinition;\r
 289     }\r
 290 \r
 291 }\r