test/jalview/datamodel/HiddenColumnsCursorTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.datamodel;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertNull;
  24 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
  25
  26 import java.util.ArrayList;
  27 import java.util.List;
  28
  29 import org.testng.annotations.Test;
  30
  31 public class HiddenColumnsCursorTest
  32 {
  33   /**
  34    * Test the method which finds the corresponding region given a column
  35    */
  36   @Test(groups = { "Functional" })
  37   public void testFindRegionForColumn()
  38   {
  39     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
  40
  41     HiddenCursorPosition pos = cursor.findRegionForColumn(20);
  42     assertNull(pos);
  43
  44     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
  45     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
  46     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
  47     cursor.resetCursor(hidden);
  48
  49     int regionIndex = cursor.findRegionForColumn(126).getRegionIndex();
  50     assertEquals(2, regionIndex);
  51
  52     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(125).getRegionIndex();
  53     assertEquals(1, regionIndex);
  54
  55     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(108).getRegionIndex();
  56     assertEquals(1, regionIndex);
  57
  58     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(104).getRegionIndex();
  59     assertEquals(1, regionIndex);
  60
  61     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(103).getRegionIndex();
  62     assertEquals(1, regionIndex);
  63
  64     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(77).getRegionIndex();
  65     assertEquals(1, regionIndex);
  66
  67     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(76).getRegionIndex();
  68     assertEquals(0, regionIndex);
  69
  70     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(53).getRegionIndex();
  71     assertEquals(0, regionIndex);
  72
  73     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(52).getRegionIndex();
  74     assertEquals(0, regionIndex);
  75
  76     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(0).getRegionIndex();
  77     assertEquals(0, regionIndex);
  78
  79     hidden.add(new int[] { 138, 155 });
  80     cursor.resetCursor(hidden);
  81
  82     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(160).getRegionIndex();
  83     assertEquals(3, regionIndex);
  84
  85     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(100).getRegionIndex();
  86     assertEquals(1, regionIndex);
  87   }
  88
  89   /**
  90    * Test the method which counts the number of hidden columns before a column
  91    */
  92   @Test(groups = { "Functional" })
  93   public void testGetHiddenOffset()
  94   {
  95     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
  96
  97     HiddenCursorPosition pos = cursor.getHiddenOffset(20);
  98     assertNull(pos);
  99
 100     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
 101     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
 102     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
 103     cursor.resetCursor(hidden);
 104
 105     int offset = cursor.getHiddenOffset(80).getHiddenSoFar();
 106     assertEquals(46, offset);
 107
 108     offset = cursor.getHiddenOffset(79).getHiddenSoFar();
 109     assertEquals(24, offset);
 110
 111     offset = cursor.getHiddenOffset(53).getHiddenSoFar();
 112     assertEquals(24, offset);
 113
 114     offset = cursor.getHiddenOffset(52).getHiddenSoFar();
 115     assertEquals(0, offset);
 116
 117     offset = cursor.getHiddenOffset(10).getHiddenSoFar();
 118     assertEquals(0, offset);
 119
 120     offset = cursor.getHiddenOffset(0).getHiddenSoFar();
 121     assertEquals(0, offset);
 122   }
 123
 124 }