JAL-4160 update args used in test suite for new CLI framework
[jalview.git] / test / jalview / gui / ScalePanelTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.gui;
22
23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
24 import static org.testng.Assert.assertTrue;
25
26 import jalview.bin.Cache;
27 import jalview.bin.Jalview;
28 import jalview.datamodel.Alignment;
29 import jalview.datamodel.AlignmentI;
30 import jalview.datamodel.Sequence;
31 import jalview.datamodel.SequenceGroup;
32 import jalview.datamodel.SequenceI;
33 import jalview.io.DataSourceType;
34 import jalview.io.FileLoader;
35 import jalview.util.MessageManager;
36 import jalview.viewmodel.ViewportRanges;
37
38 import java.awt.event.MouseEvent;
39
40 import javax.swing.JMenuItem;
41 import javax.swing.JPopupMenu;
42
43 import org.testng.annotations.BeforeClass;
44 import org.testng.annotations.Test;
45
46 public class ScalePanelTest
47 {
48   @BeforeClass(alwaysRun = true)
49   public void setUpJvOptionPane()
50   {
51     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
52     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
53   }
54
55   @Test(groups = "Functional")
56   public void testPreventNegativeStartColumn()
57   {
58     SequenceI seq1 = new Sequence("Seq1", "MATRESS");
59     SequenceI seq2 = new Sequence("Seq2", "MADNESS");
60     AlignmentI al = new Alignment(new SequenceI[] { seq1, seq2 });
61
62     AlignFrame alignFrame = new AlignFrame(al, al.getWidth(),
63             al.getHeight());
64     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
65
66     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, 4, 0, 1, false);
67     scalePanel.mousePressed(mouse);
68     scalePanel.mouseDragged(mouse);
69
70     // simulate dragging selection leftwards beyond the sequences giving
71     // negative X
72     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, -30, 0, 1, false);
73
74     scalePanel.mouseReleased(mouse);
75
76     SequenceGroup sg = scalePanel.av.getSelectionGroup();
77     int startCol = sg.getStartRes();
78
79     assertTrue(startCol >= 0);
80   }
81
82   /**
83    * Test for JAL-3212
84    */
85   @Test(groups = "Functional")
86   public void testSelectColumns_withHidden()
87   {
88     String seq1 = ">Seq1\nANTOFAGASTAVALPARAISOMONTEVIDEOANTANANARIVO";
89     AlignFrame alignFrame = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(seq1,
90             DataSourceType.PASTE);
91     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
92
93     /*
94      * hide columns 1-20 (of 43); then 'drag' to select columns 30-31;
95      * 31 is 51 in absolute columns but bug JAL-3212 reduces it to
96      * endRes which is 22
97      */
98     AlignViewport viewport = alignFrame.getViewport();
99     ViewportRanges ranges = viewport.getRanges();
100     assertEquals(ranges.getStartRes(), 0);
101     assertEquals(ranges.getEndRes(), 42);
102     viewport.hideColumns(0, 19);
103     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
104     assertEquals(ranges.getStartRes(), 0);
105     assertEquals(ranges.getEndRes(), 22);
106
107     int cw = viewport.getCharWidth();
108     int xPos = 9 * cw + 2;
109     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1,
110             false);
111     scalePanel.mousePressed(mouse);
112     scalePanel.mouseDragged(mouse);
113     xPos += cw;
114     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
115     scalePanel.mouseReleased(mouse);
116
117     SequenceGroup sg = scalePanel.av.getSelectionGroup();
118     assertEquals(sg.getStartRes(), 29);
119     assertEquals(sg.getEndRes(), 30);
120   }
121
122   @Test(groups = "Functional")
123   public void testBuildPopupMenu()
124   {
125     final String hide = MessageManager.getString("label.hide_columns");
126     final String reveal = MessageManager.getString("label.reveal");
127     final String revealAll = MessageManager.getString("action.reveal_all");
128
129     String seq1 = ">Seq1\nANTOFAGASTA";
130     AlignFrame alignFrame = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(seq1,
131             DataSourceType.PASTE);
132     ScalePanel scalePanel = alignFrame.alignPanel.getScalePanel();
133     AlignViewport viewport = alignFrame.getViewport();
134     int cw = viewport.getCharWidth();
135
136     /*
137      * hide columns 3-4 (counting from 0)
138      */
139     viewport.hideColumns(3, 4);
140     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
141
142     /*
143      * verify popup menu left/right of hidden column marker
144      * NB need to call mouseMoved first as this sets field 'reveal'
145      */
146     int xPos = 1 * cw + 2; // 2 columns left of hidden marker
147     MouseEvent mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1,
148             false);
149     scalePanel.mouseMoved(mouse);
150     JPopupMenu popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
151     assertEquals(popup.getSubElements().length, 0);
152
153     /*
154      * popup just left of hidden marker has 'Reveal'
155      */
156     xPos = 2 * cw + 2;
157     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
158     scalePanel.mouseMoved(mouse);
159     popup = scalePanel.buildPopupMenu(2);
160     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
161     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
162
163     /*
164      * popup just right of hidden marker has 'Reveal'
165      */
166     xPos = 3 * cw + 2;
167     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
168     scalePanel.mouseMoved(mouse);
169     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5); // allowing for 2 hidden columns
170     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
171     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
172
173     /*
174      * popup further right is empty
175      */
176     xPos = 4 * cw + 2;
177     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
178     scalePanel.mouseMoved(mouse);
179     popup = scalePanel.buildPopupMenu(6); // allowing for 2 hidden columns
180     assertEquals(popup.getSubElements().length, 0);
181
182     /*
183      * 'drag' to select columns around the hidden column marker
184      */
185     xPos = 1 * cw + 2;
186     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
187     scalePanel.mousePressed(mouse);
188     scalePanel.mouseDragged(mouse);
189     xPos = 5 * cw + 2;
190     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
191     scalePanel.mouseReleased(mouse);
192
193     /*
194      * popup 2 columns left of marker: 'Hide' only
195      */
196     xPos = 1 * cw + 2;
197     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
198     scalePanel.mouseMoved(mouse);
199     popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
200     assertEquals(popup.getSubElements().length, 1);
201     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), hide);
202
203     /*
204      * popup just left of marker: 'Reveal' and 'Hide'
205      */
206     xPos = 2 * cw + 2;
207     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
208     scalePanel.mouseMoved(mouse);
209     popup = scalePanel.buildPopupMenu(1);
210     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
211     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
212     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(), hide);
213
214     /*
215      * popup just right of marker: 'Reveal' and 'Hide'
216      */
217     xPos = 3 * cw + 2;
218     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
219     scalePanel.mouseMoved(mouse);
220     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
221     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
222     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
223     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(), hide);
224
225     /*
226      * hiding a second region adds option 'Reveal all' to 'Reveal'
227      */
228     viewport.hideColumns(6, 7);
229     alignFrame.alignPanel.updateLayout();
230     xPos = 3 * cw + 2;
231     mouse = new MouseEvent(scalePanel, 0, 1, 0, xPos, 0, 1, false);
232     scalePanel.mouseMoved(mouse);
233     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
234     assertEquals(popup.getSubElements().length, 3);
235     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
236     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(),
237             revealAll);
238     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[2]).getText(), hide);
239
240     alignFrame.deselectAllSequenceMenuItem_actionPerformed(null);
241     popup = scalePanel.buildPopupMenu(5);
242     assertEquals(popup.getSubElements().length, 2);
243     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[0]).getText(), reveal);
244     assertEquals(((JMenuItem) popup.getSubElements()[1]).getText(),
245             revealAll);
246   }
247
248   @BeforeClass(alwaysRun = true)
249   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
250   {
251     /*
252      * use read-only test properties file
253      */
254     Cache.loadProperties("test/jalview/io/testProps.jvprops");
255     Jalview.main(new String[] { "--nonews" });
256   }
257
258 }