utils/getdown/jalviewc-windows

   1 #!/usr/bin/env bash
   2
   3 ARG1=$1
   4 DIR="$(dirname "$(readlink -f "$0")")"
   5
   6 # check to see if $1 is set and is not start of other cli set args
   7 OPEN=""
   8 if [ -n "${ARG1}" -a "${ARG1}" = "${ARG1#-}" -a "${ARG1}" != "open" ]; then
   9  # first argument exists and does not start with a "-" and is not "open"
  10  OPEN="-open"
  11 fi
  12
  13 APPDIR="${DIR}"
  14 JAVA="${APPDIR}/jre/bin/java"
  15 GETDOWNTXT="${APPDIR}/getdown.txt"
  16 CLASSPATH=""
  17 if [ -e "${GETDOWNTXT}" ]; then
  18   for JAR in $(grep -e '^code\s*=\s*' "${GETDOWNTXT}" | sed -e 's/^code\s*=\s*//;'); do
  19     [ -n "${CLASSPATH}" ] && CLASSPATH="${CLASSPATH}:"
  20     CLASSPATH="${CLASSPATH}${APPDIR}/${JAR}"
  21   done
  22 else
  23   echo "Cannot find getdown.txt" >&2
  24   exit 3
  25 fi
  26
  27 if [ \! -e "${JAVA}" ]; then
  28   echo "Cannot find bundled java, using system and hoping for the best!" >&2
  29   JAVA=java
  30 fi
  31
  32 declare -a ARGS=("${@}")
  33
  34 # change paths for Cygwin or Windows Subsystem for Linux (WSL)
  35 if [ "$(uname -o)" = "Cygwin" ]; then
  36   echo "When using relative paths in args within Cygwin, please start with './' or '../'" >&2
  37   CLASSPATH=$(cygpath -pw "${CLASSPATH}")
  38   # now for some arg paths fun. only translating paths starting with './', '../' or '/'
  39   ARGS=()
  40   for ARG in "${@}"; do
  41     if [ "${ARG}" != "${ARG#./}" -o "${ARG}" != "${ARG#/}" -o "${ARG}" != "${ARG#../}" ]; then
  42       ARGS=( "${ARGS[@]}" "$(cygpath -aw "${ARG}")" )
  43     else
  44       ARGS=( "${ARGS[@]}" "${ARG}" )
  45     fi
  46   done
  47   JAVA="${JAVA}.exe"
  48 elif uname -r | grep Microsoft >/dev/null; then
  49   echo "When using relative paths in args within WSL. please start with './' or '../'" >&2
  50   WCLASSPATH=""
  51   OLD_IFS="${IFS}"
  52   IFS=":"
  53   for JAR in $CLASSPATH; do
  54     [ -n "${WCLASSPATH}" ] && WCLASSPATH="${WCLASSPATH};"
  55     WCLASSPATH="${WCLASSPATH}$(wslpath -aw "${JAR}")"
  56   done
  57   CLASSPATH="${WCLASSPATH}"
  58   IFS="${OLD_IFS}"
  59   ARGS=()
  60   for ARG in "${@}"; do
  61     if [ "${ARG}" != "${ARG#./}" -o "${ARG}" != "${ARG#/}" -o "${ARG}" != "${ARG#../}" ]; then
  62       # annoyingly wslpath does not work if the file doesn't exist!
  63       ARGBASENAME="$(basename "${ARG}")"
  64       ARGDIRNAME="$(dirname "${ARG}")"
  65       ARGS=( "${ARGS[@]}" "$(wslpath -aw "${ARGDIRNAME}")\\${ARGBASENAME}" )
  66     else
  67       ARGS=( "${ARGS[@]}" "${ARG}" )
  68     fi
  69   done
  70   JAVA="${JAVA}.exe"
  71 fi
  72
  73 # don't quote $OPEN
  74 "${JAVA}" -cp "${CLASSPATH}" jalview.bin.Launcher ${OPEN} "${ARGS[@]}"