JAL-2360 refactoring for JalviewColourScheme enum,
[jalview.git] / examples / appletParameters.html
index 433f5a9..6ead5e6 100644 (file)
@@ -28,7 +28,7 @@ which are described <a href="#parameters"> below</a>. Once initialised,
 the applet can be interacted with <em>via</em> its 
 <a href="javascript:doSubmit('jalviewLiteJs')">Javascript API</a>. 
 </p><p><strong>Issues arising from tightening of Java Security default settings</strong><br/>JalviewLite is provided as a signed applet with 'sandbox' permissions and wildcards that allow it to be run from any website. Unfortunately, earlier versions of Java may not be compatible with these settings. </p>
-    <p>For additional deployment notes, <a href="#appletdeploymentnotes">see below</a>.</p>
+    <p>For additional deployment notes, <a href="javascript:doSubmit('appletDeployment')">see Applet Deployment</a>.</p>
            <p><h2>Applet Parameters</h2><br/>The applet takes the following initialisation parameters.</p>
         <a name="parameters"></a>        <table width="97%" class="borderTable" align="center" >
           <tr> 
@@ -114,7 +114,7 @@ the applet can be interacted with <em>via</em> its
             <td>defaultColour</td>
             <td> <em>One of: </em><br>
               Clustal, Blosum62, % Identity, Hydrophobic, Zappo, Taylor, Helix 
-              Propensity, Strand Propensity, Turn Propensity, Buried Index, Nucleotide, T-Coffee Scores, RNA Helices</td>
+              Propensity, Strand Propensity, Turn Propensity, Buried Index, Nucleotide, Purine/Pyrimidine, T-Coffee Scores, RNA Helices</td>
             <td>Default is no colour.</td>
           </tr>
           <tr>