JAL-3224 JAL-3225 Fixed help image mangling, moved help to help/help and added this...
[jalview.git] / help / help / html / features / jalarchive.html
diff --git a/help/help/html/features/jalarchive.html b/help/help/html/features/jalarchive.html
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..94180a6
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,45 @@
+<html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>Jalview Archives</title>
+</head>
+<body>
+
+  <p>
+    <strong>Jalview Project Archives</strong>
+  </p>
+
+  <p>These are java archives of an XML file containing alignments,
+    trees and Jalview display information. A data exchange standard is
+    currently being developed, so there is no stable schema yet, but
+    Jalview web services will soon make use of the same interchange
+    format.</p>
+  <p>
+    For those who want to know...<br> Jalview uses java classes
+    automatically created using <a href="http://www.castor.org">Castor</a>.
+    Jalview 2.08 uses descriptor classes which significantly increase
+    the speed of marshalling / unmarshalling java objects into XML.
+    Files created prior to Jalview 2.08 can still be read in, but they
+    will be saved in the new format.
+  </p>
+</body>
+</html>