Merge branch 'improvement/JAL-3280_Migrate_the_VersionChecker_service_to_build_proper...
[jalview.git] / help / help / html / releases.html
index 143c7c0..6b40e9e 100755 (executable)
@@ -122,6 +122,12 @@ li:before {
       <td align="left" valign="top">
         <ul>
           <li>
+            <!-- JAL-3691 -->Conservation and Quality tracks are shown
+            but not calculated and no protein or DNA score models are
+            available for tree/PCA calculation when launched with
+            Turkish language locale
+          </li>
+          <li>
             <!-- JAL-3493 -->Escape does not clear highlights on the
             alignment (Since Jalview 2.10.3)
           </li>
@@ -163,6 +169,19 @@ li:before {
             <!-- JAL-3597 -->Resolved memory leaks in Tree and PCA
             panels, Alignment viewport and annotation renderer.
           </li>
+          <li>
+            <!-- JAL-3561 -->Jalview ignores file format parameter
+            specifying output format when exporting an alignment via the
+            command line
+          </li>
+          <li>
+            <!-- JAL-3667 -->Windows 10: For a minority of users, if
+            backups are not enabled, Jalview sometimes fails to
+            overwrite an existing file and raises a warning dialog. (in
+            2.11.0, and 2.11.1.0, the workaround is to try to save the
+            file again, and if that fails, delete the original file and
+            save in place.)
+          </li>
         </ul> <em>Developing Jalview</em>
         <ul>
           <li>
@@ -178,21 +197,18 @@ li:before {
             tooltips. (Also affects v2.11.1.0)
           </li>
           <li>
-            <!-- JAL-3667 -->Windows 10: For a minority of users, if
-            backups are not enabled, Jalview sometimes fails to
-            overwrite an existing file and raises a warning dialog.
-            Workaround is to try to save the file again, and if that
-            fails, delete the original file and save in place.
-          </li>
-          <li>
             <!-- JAL-3702 -->Drag and drop of alignment file onto
-            alignment window not working correctly when in a HiDPI
-            scaled mode in Linux
+            alignment window when in a HiDPI scaled mode in Linux only
+            works for the top left quadrant of the alignment window
           </li>
           <li>
             <!-- JAL-3701 -->Stale build data in jalview standalone jar
             builds (only affects 2.11.1.1 branch)
           </li>
+          <li>
+            <!-- JAL-3127 -->Sequence ID colourscheme not re-applied
+            when alignment view restored from project (since Jalview 2.11.0)
+          </li>
         </ul>
       </td>
     </tr>