JAL-3224 JAL-3225 Fixed help image mangling, moved help to help/help and added this...
[jalview.git] / help / html / calculations / redundancy.html
diff --git a/help/html/calculations/redundancy.html b/help/html/calculations/redundancy.html
deleted file mode 100755 (executable)
index 5b1badb..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,40 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
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- -->
-<head>
-<title>Removing Redundancy</title>
-</head>
-<body>
-  <p>
-    <strong>Removing redundancy</strong>
-  </p>
-  <p>
-    Selecting the option in the Alignment window's <strong>Edit</strong>
-    menu or pressing <strong>'CONTROL+D'</strong> brings up a dialog box
-    asking you to select a threshold. If the percentage identity between
-    the aligned positions of any two sequences in the visible alignment
-    exceeds this value, the shorter sequence is discarded.<br> <em>Note:</em>
-    The redundancy calculation is done when the dialog box is opened.
-    For large numbers of sequences this can take a long time as all
-    pairs have to be compared.
-  </p>
-</body>
-</html>