JAL-3224 JAL-3225 Fixed help image mangling, moved help to help/help and added this...
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / hydrophobic.html
diff --git a/help/html/colourSchemes/hydrophobic.html b/help/html/colourSchemes/hydrophobic.html
deleted file mode 100755 (executable)
index 5caae8d..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,80 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3
- * of the License, or (at your option) any later version.
- *  
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
- -->
-<head>
-<title>Hydrophobic Colour Scheme</title>
-<style type="text/css">
-<!--
-td {
-       text-align: center;
-}
--->
-</style>
-</head>
-
-<body>
-  <p>
-    <strong>Hydrophobicity</strong>
-  </p>
-  <p>According to the hydrophobicity table of Kyte, J., and
-    Doolittle, R.F., J. Mol. Biol. 1157, 105-132, 1982. The most
-    hydrophobic residues according to this table are coloured red and
-    the most hydrophilic ones are coloured blue.</p>
-  <div align="center">
-    <table width="400" border="1">
-      <tr>
-        <td bgcolor="#ff0000">I</td>
-        <td bgcolor="#f60009">V</td>
-        <td bgcolor="#ea0015">L</td>
-        <td bgcolor="#cb0034">F</td>
-        <td bgcolor="#c2003d">C</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td bgcolor="#b0004f">M</td>
-        <td bgcolor="#ad0052">A</td>
-        <td bgcolor="#6a0095">G</td>
-        <td bgcolor="#680097">X</td>
-        <td bgcolor="#61009e">T</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td bgcolor="#5e00a1">S</td>
-        <td bgcolor="#5b00a4">W</td>
-        <td bgcolor="#4f00b0">Y</td>
-        <td bgcolor="#4600b9">P</td>
-        <td bgcolor="#1500ea">H</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td bgcolor="#0c00f3">E</td>
-        <td bgcolor="#0c00f3">Z</td>
-        <td bgcolor="#0c00f3">Q</td>
-        <td bgcolor="#0c00f3">D</td>
-        <td bgcolor="#0c00f3">B</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        </td>
-        <td bgcolor="#0c00f3">N</td>
-        <td bgcolor="#0000ff">K</td>
-        <td bgcolor="#0000ff">R</td>
-      </tr>
-    </table>
-  </div>
-</body>
-</html>