JAL-3224 JAL-3225 Fixed help image mangling, moved help to help/help and added this...

[jalview.git] / help / html / colourSchemes / pid.html
diff --git a/help/html/colourSchemes/pid.html b/help/html/colourSchemes/pid.html

deleted file mode 100755 (executable)

index 3a5e631..0000000
--- a/help/html/colourSchemes/pid.html
+++ /dev/null
@@ -1,58 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
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- *  
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- * 
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- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
- -->
-<head>
-<title>Percentage Identity Colour Scheme</title>
-<style type="text/css">
-<!--
-td {
-       text-align: center;
-}
--->
-</style>
-</head>
-
-<body>
-  <p>
-    <strong>PID Colours</strong><br> <br> The PID option
-    colours the residues (boxes and/or text) according to the percentage
-    of the residues in each column that agree with the consensus
-    sequence. Only the residues that agree with the consensus residue
-    for each column are coloured.
-  </p>
-  <div align="center">
-    <table width="200" border="1">
-      <tr>
-        <td bgcolor="#6464FF">&gt; 80 %</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td bgcolor="#9999FF">&gt; 60 %</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td bgcolor="#CCCCFF">&gt; 40%</td>
-      </tr>
-      <tr>
-        <td>&lt; 40%</td>
-      </tr>
-    </table>
-  </div>
-</body>
-</html>