git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
apply version 2.7 copyright
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / user.html
diff --git a/help/html/colourSchemes/user.html b/help/html/colourSchemes/user.html
index e18e273..1f48afa 100755 (executable)
--- a/help/html/colourSchemes/user.html
+++ b/help/html/colourSchemes/user.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -16,3 +16,24 @@
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
 -->
+<head><title>User Defined Colours</title></head>
+<body>
+<p><em>User Defined Colours</em></p>
+<p><img src="userDefined.gif" width="719" height="368"> </p>
+<p>You may define any number of new colour schemes, each with a unique name. <br>
+  <br>
+  Each of the residues in a new colour scheme may be assigned a new user defined 
+  colour. <br>
+  <br>
+  Click &quot;Apply&quot; or &quot;OK&quot; to set your new colours on the active 
+  alignment window. </p>
+<p>Click &quot;Cancel&quot; to undo your changes if you pressed the &quot;Apply&quot; 
+  button. <br>
+  <br>
+  If you save your colour scheme with a unique name the colour scheme name will 
+  be added to the &quot;Colour&quot; menu on each new alignment window.<br>
+  <br>
+  Any saved colour schemes will be automatically loaded the next time you use 
+  Jalview.</p>
+</body>
+</html>