git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
apply version 2.7 copyright
[jalview.git] / help / html / features / annotation.html
diff --git a/help/html/features/annotation.html b/help/html/features/annotation.html
index 812ed50..4e4ea73 100755 (executable)
--- a/help/html/features/annotation.html
+++ b/help/html/features/annotation.html
@@ -1,4 +1,21 @@
 <html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * 
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+-->
 <head><title>Alignment Annotation</title></head>
 <body>
 <p><strong>Alignment Annotation</strong></p>
@@ -41,6 +58,8 @@ area (below the sequence ID area).
         to the annotation (numerical or otherwise) at each position in the row. 
         This is useful to export alignment quality measurements for further analysis.</em> 
       </li>
+      <li><strong>Scale Label To Column</strong><em>(introduced in 2.5)</em><br>
+      <em>Selecting this toggles whether column labels will be shrunk to fit within each column, or displayed using the view's standard font size.</em></li>
 </ul>
 <p>
 <strong>Editing Label and secondary structure Annotation</strong></p>
@@ -79,7 +98,7 @@ User defined annotation is stored and retrieved using <a
 href="../features/jalarchive.html">Jalview Archives</a>.
 </p>
 <p><em>Current Limitations</em></p>
-<p>As of version 2.4, the Jalview user interface does not support the 
+<p>As of version 2.5, the Jalview user interface does not support the 
 creation and editing quantitative annotation (histograms and line graphs), or 
 to create annotation associated with a specific sequence. It is also incapable of
 annotation grouping or changing the style of existing annotation (to change between line or bar charts, or to make multiple line graphs). These annotation capabilities are only possible by the import of an