JAL-1620 version bump and release notes
[jalview.git] / help / html / features / chimera.html
index 236701a..a917c13 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
@@ -24,7 +24,7 @@
 </head>
 <body>
 <p><strong>The Chimera Viewer</strong></p>
-<p>Since Jalview 2.8.2, <a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/">Chimera</a>
+<p>Since Jalview 2.8.2, <a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/">Chimera</a> (http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/)
 has been integrated into Jalview for interactively viewing structures
 opened by entries in the <strong>&quot;Structure&quot;</strong> submenu in the <a href="../menus/popupMenu.html">sequence
 id pop-up menu</a> (if you can't see this, then you need to <a
@@ -69,7 +69,8 @@ residue number and chain code
 ([RES]Num:Chain). Moving the mouse over an
 associated residue in an alignment window highlights the associated
 atoms in the displayed structures. For comprehensive details of Chimera's commands, refer to the tool's Help menu.</p>
-<p>Basic screen operations (see <a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/current/docs/UsersGuide/mouse.html">Chimera help</a> for full details).
+<p>Basic screen operations (see <a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/current/docs/UsersGuide/mouse.html">Chimera help</a> 
+(http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/current/docs/UsersGuide/mouse.html) for full details).
 <table border="1">
        <tr>
                <td><strong>Action</strong></td>