Merge branch 'develop' of https://source.jalview.org/git/jalview.git into develop
[jalview.git] / help / html / features / commandline.html
index 9cffc51..92d9323 100644 (file)
     provided by InstallAnywhere any output from the application will be
     sent to output.txt, not standard out.<br> The Jalview
     application also requires a number of additional libraries on the
-    class path. The command line below adds the Jalview installation's
-    'lib' directory to the list of directories that are searched for
-    jars to be added to the classpath:
+    class path. The command line below adds all the jar files in the
+    Jalview installation's 'lib' directory to the classpath, as well as
+    the Jalview application jar file:
   </p>
-  <pre>java -Djava.ext.dirs=$INSTALL_DIR$/lib -cp $INSTALL_DIR$/jalview.jar jalview.bin.Jalview -open [FILE] </pre>
+  <pre>java -classpath "$INSTALL_DIR$/lib/*:$INSTALL_DIR$/jalview.jar" jalview.bin.Jalview -open [FILE] </pre>
   <p>
     Use '-help' to get more information on the <a
       href="clarguments.html">command line arguments</a> that