JAL-1620 version bump and release notes
[jalview.git] / help / html / features / creatinFeatures.html
index 04e5fdc..644e745 100644 (file)
@@ -1,38 +1,58 @@
-<html>\r
-<head>\r
-<title>Creating Sequence Features</title>\r
-</head>\r
-<body>\r
-<strong>Creating Sequence Features</strong>\r
-<p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a\r
-       href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently\r
-selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create\r
-sequence feature&quot;</strong> entry in the selection area popup menu. In both\r
-cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be\r
-opened:</p>\r
-<img src="crnewfeature.gif">\r
-<p>Select or enter the attributes for the features being created,\r
-and then press OK to create the new features.</p>\r
-<p>Each attribute is described below:\r
-<ul>\r
-       <li><strong>Sequence Feature Name</strong>\r
-       <p>Either give the new features a new name or use the menu to\r
-       re-use an existing feature name.</p>\r
-       </li>\r
-       <li><strong>Feature group</strong>\r
-       <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the\r
-       pull-down menu.</p>\r
-       </li>\r
-       <li><strong>Feature Colour</strong>\r
-       <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or\r
-       select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>\r
-       </li>\r
-       <li><strong>Description</strong>\r
-       <p>Enter a description for all the features being created. Each\r
-       feature defined on a sequence may have its own description that will be\r
-       displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>\r
-       </li>\r
-</ul>\r
-</p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>\r
-</body>\r
-</html>
\ No newline at end of file
+<html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2b1)
+ * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<head>
+<title>Creating Sequence Features</title>
+</head>
+<body>
+<strong>Creating Sequence Features</strong>
+<p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a
+       href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently
+selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create
+sequence feature&quot;</strong> entry in the <a href="../menus/popupMenu.html">selection area popup menu</a>. In both
+cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be
+opened:</p>
+<p><img src="crnewfeature.gif"></p>
+<p>Select or enter the attributes for the features being created,
+and then press OK to create the new features.</p>
+<p>Each attribute is described below:
+<ul>
+       <li><strong>Sequence Feature Name</strong>
+       <p>Either give the new features a new name or use the menu to
+       re-use an existing feature name.</p>
+       </li>
+       <li><strong>Feature group</strong>
+       <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the
+       pull-down menu.</p>
+       </li>
+       <li><strong>Feature Colour</strong>
+       <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or
+       select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>
+       </li>
+       <li><strong>Description</strong>
+       <p>Enter a description for all the features being created. Each
+       feature defined on a sequence may have its own description that will be
+       displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>
+       </li>
+</ul>
+</p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>
+</body>
+</html>