2.2 documentation
[jalview.git] / help / html / features / dassettings.html
index f3e325d..30b36b1 100644 (file)
@@ -1,32 +1,32 @@
-<html>\r
-\r
-<head><title>DAS Settings</title></head>\r
-\r
-<body>\r
-<p><strong>DAS Settings</strong></p>\r
-<p>Jalview can retrieve and visualize features from many <a href="http://biodas.org/">DAS</a> \r
-  sources at once. The DAS sources are discovered and selected <em>via</em> the DAS settings panel.</p>\r
-<p><img src="das.jpg" width="497" height="365">\r
-<p>The available sources are listed in the table using each source's\r
-Nickname as its identifier. Clicking on a source's entry in the table\r
-reveals more information about that service in the panel to the\r
-right. Select the tickbox in the &quot;Use Source&quot; column for a\r
-source to add it to the set Jalview queries for alignment and sequence\r
-features.\r
-</p>\r
-<p>You can filter the visible DAS sources by authority, type and &quot;label&quot;. \r
-  You should read the DAS documentation to understand more about these values.\r
-<p><strong>Updating the list of sources</strong></p>\r
-<p>When the DAS Settings panel is first opened, and when the <strong>'Refresh\r
-  source'</strong> buton is pressed, a list of DAS sources\r
-  is retrieved from the DAS registry URL (set by default to the DAS\r
-  registration server at\r
-  http://das.sanger.ac.uk/registry/das1/sources/).</p>\r
-<p><strong>Adding your own DAS Sources</strong></p>\r
-<p>You can add your own DAS source to the list by clicking the &quot;Add Local \r
-  Source&quot; button. Enter the URL and nickname of your additional service. \r
-  It should be noted that Jalview 2.1 will not query additional sources for more \r
-  information, but this will be implemented in future editions. \r
-<p>&nbsp;\r
-</body>\r
-</html>\r
+<html>
+
+<head><title>DAS Settings</title></head>
+
+<body>
+<p><strong>DAS Settings</strong></p>
+<p>Jalview can retrieve and visualize features from many <a href="http://biodas.org/">DAS</a> 
+  sources at once. The DAS sources are discovered and selected <em>via</em> the DAS settings panel.</p>
+<p><img src="das.gif">
+<p>The available sources are listed in the table using each source's
+Nickname as its identifier. Clicking on a source's entry in the table
+reveals more information about that service in the panel to the
+right. Select the tickbox in the &quot;Use Source&quot; column for a
+source to add it to the set Jalview queries for alignment and sequence
+features.
+</p>
+<p>You can filter the visible DAS sources by authority, type and &quot;label&quot;. 
+  You should read the DAS documentation to understand more about these values.
+<p><strong>Updating the list of sources</strong></p>
+<p>When the DAS Settings panel is first opened, and when the <strong>'Refresh
+  source'</strong> buton is pressed, a list of DAS sources
+  is retrieved from the DAS registry URL (set by default to the DAS
+  registration server at
+  http://das.sanger.ac.uk/registry/das1/sources/).</p>
+<p><strong>Adding your own DAS Sources</strong></p>
+<p>You can add your own DAS source to the list by clicking the &quot;Add Local 
+  Source&quot; button. Enter the URL and nickname of your additional service. 
+  It should be noted that Jalview 2.1 will not query additional sources for more 
+  information, but this will be implemented in future editions. 
+<p>&nbsp;
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