Merge branch 'develop' into task/JAL-2196pdbeProperties
[jalview.git] / help / html / features / ensemblsequencefetcher.html
index 54b57a3..e547c58 100644 (file)
   retrieve annotated transcripts, peptides and genomic contigs from
   <a href="http://www.ensembl.org">ENSEMBL</a>.
   <br />
-  <img src="selectfetchdb.gif" align="left" width="480" height="204"
-    alt="Database selection dialog for fetching sequences (introduced in Jalview 2.8)">
+  <img src="selectfetchdb.gif" align="right" width="480" height="204"
+    alt="Database selection dialog with Ensembl sequence source tooltip">
 
-  <p>
-    Two types of ENSEMBL source are provided. ENSEMBL queries the main
-    ENSEMBL warehouse containing data for higher eukaryotes, and
+  <p>Two types of ENSEMBL source are provided. ENSEMBL queries the
+    main ENSEMBL warehouse containing data for higher eukaryotes, and
     EnsemblGenomes, which queries Ensembl Pathogens, and other
-    warehouses.<br />
-    <em>Ensembl support is new in Jalview, and we expect to merge
-      these sources in a future release.</em>
-  </p>
+    warehouses.</p>
   <p>
-    <strong>General Use</strong><br /> If you have a set of Ensembl gene
-    or transcript IDs, then you can retrieve them <em>via</em> the
+    <strong>General Use</strong><br /> If you have a set of Ensembl
+    gene or transcript IDs, then you can retrieve them <em>via</em> the
     sequence fetcher dialog opened after selecting the most appropriate
     source (either 'ENSEMBL', or Ensembl Genomes). However, Jalview's
     Ensembl client has a couple of additional capabilities: