2.08 update
[jalview.git] / help / html / features / featuresFormat.html
index 8e6ee13..a97d957 100755 (executable)
@@ -4,6 +4,9 @@
 \r
 <body>\r
 <p><strong>Sequence Features File Format</strong></p>\r
+<p>Note: This format is primarily intended to be used for the applet, which does \r
+  not have an XML parser and where file size must be kept to a minimum to reduce \r
+  download time.</p>\r
 <p>(Prior to version 2.08 known as the &quot;Groups file&quot;)<br>\r
   A precalculated Features file can read onto an alignment from the command line \r
   (&quot;-features&quot;), by drag and dropping the features file onto an alignment \r
@@ -12,7 +15,7 @@
 <p>featureType&lt;tab&gt;colour<br>\r
   description&lt;tab&gt;sequenceId&lt;tab&gt;sequenceIndex&lt;tab&gt;start&lt;tab&gt;end&lt;tab&gt;featureType</p>\r
 <p>eg<br>\r
-  <font size="2" face="Courier New, Courier, mono">domain red<br>\r
+  <font size="3" face="Courier New, Courier, mono">domain red<br>\r
   metal ion-binding site 00ff00<br>\r
   transit peptide 0,105,215<br>\r
   chain 225,105,0<br>\r
@@ -27,7 +30,7 @@
   Your Own description here Q93XJ9_SOLTU -1 49 144 chain</font></p>\r
 <p>An additional option in Jalview 2.08 is to group features in the following \r
   way: </p>\r
-<p><font size="2" face="Georgia, Times New Roman, Times, serif">STARTGROUP&lt;tab&gt;My feature groupA<br>\r
+<p><font size="3" face="Georgia, Times New Roman, Times, serif">STARTGROUP&lt;tab&gt;My feature groupA<br>\r
   ....Many Feature descriptions here<br>\r
   ENDGROUP&lt;tab&gt;My feature groupA</font><br>\r
 </p>\r