JAL-1544 typos/formatting in help (and Phylip added)
[jalview.git] / help / html / features / featuresettings.html
index 63217ee..3830302 100755 (executable)
@@ -76,8 +76,8 @@ alignment based on the average score or total number of currently active
 features and groups on each sequence. To order the alignment using a
 specific feature type, use the <em>sort by ..</em> entries in the pop-up
 menu for that type.<br>
-<em>Feature sorting and graduated feature colouring was introduced
-in jalview 2.5</em></p>
+<em>Feature sorting and graduated feature colouring were introduced
+in Jalview 2.5</em></p>
 
 <p><strong>Transparency and Feature Ordering</strong></p>
 <p>It is important to realise that sequence features are often not
@@ -85,7 +85,7 @@ distinct and often overlap (for example, a metal binding site feature
 may be attached to one position along a stretch of sequence marked with
 a secondary structure feature).</p>
 <p>The ordering of the sequence features in the dialog box list is
-the order used by jalview for rendering sequence features. A feature at
+the order used by Jalview for rendering sequence features. A feature at
 the bottom of the list is rendered <em>below</em> a feature higher up in
 the list.<br>
 <em><strong>You can change the order of a feature by