Merge branch 'releases/Release_2_10_4_Branch' into develop
[jalview.git] / help / html / features / jmol.html
index 0cd6168..ac2489b 100644 (file)
 </p> -->
   <p>
     <a name="align"><strong>Superposing structures based on
-        their aligned sequences</strong></a><br> If several structures are
-    available on the alignment, you may add additional structures to an
-    existing Jmol view by selecting their entry in the appropriate
-    pop-up menu. Jalview will ask you if you wish to add the structure
-    to the existing alignment, and if you do, it will import and
-    superimpose the new PDB file using the corresponding positions from
-    the alignment. If the alignment is subsequently edited, you can use
-    the <a href="#sAlign"><em>Jmol&#8594;Align</em></a> menu option from
-    the menu bar of the structure view window to superpose the
-    structures using the updated alignment.<br> <em>Sequence
+        their aligned sequences</strong></a><br> If several structures are shown
+    in a view, you can superimpose them using the corresponding
+    positions from the alignment via the <a href="#sAlign"><em>Jmol&#8594;Align</em></a>
+    menu option from the menu bar of the structure view window. <br> <em>Sequence
       based structure superposition was added in Jalview 2.6</em>
   </p>
   <p>