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index e18e273..78d18a6 100644 (file)
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 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9)
+ * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
+<title>New Key Strokes and Menus</title>
+<body>
+  <strong>New Key Strokes and Menus</strong>
+  <p>
+    Many new <a href="../keys.html">keyboard shortcuts</a> have been
+    added in Jalview 2.2 to make editing, selecting and navigating an
+    alignment even easier. The selection commands in the <strong>Edit</strong>
+    menu, and the alignment formatting controls within the <strong>View</strong>
+    menu have also been moved into their own respective <strong>Select</strong>
+    and <strong>Format</strong> menus.
+  </p>
+  <p>Some of the more important new keystrokes are shown below :
+  <ul>
+    <li><strong>Page Up</strong> and <strong>Page Down</strong>
+      scrolls through the alignment view.</li>
+    <li><strong>Control I</strong> inverts the currently selected
+      sequence set, and <strong>Control Alt I</strong> will invert the
+      currently selected set of columns.
+    <li><strong>Control V</strong> will paste the contents of the
+      clipboard to the current alignment window, and <strong>Control
+        Shift V</strong> pastes the data to a new window.</li>
+    <li><strong>Control O</strong> opens the file browser for
+      loading a new alignment or Jalview archive.</li>
+    <li><strong>Control S</strong> saves the alignment with the
+      current filename and format, and <strong>Control Shift S</strong>
+      opens the <strong>Save As...</strong> dialog box.</li>
+    <li><strong>Control T</strong> creates a new alignment view,
+      and <strong>Control W</strong> closes the current view, or if none
+      remain, then the whole alignment.</li>
+    <li><strong>Control E</strong> will remove gapped columns in
+      the alignment.</li>
+    <li><strong>Control D</strong> opens the <strong>Remove
+        Redundancy</strong> dialog box.</li>
+  </ul>
+  </p>
+</body>
+</html>