JAL-1717 updated the PDBEntry model and updated the method use for its equality test...
[jalview.git] / help / html / features / pdbsequencefetcher.html
index 0a7802e..15dc2c6 100644 (file)
                or to cross-reference other bioinformatics websites before retrieving
                a sequence data in jalview. The underlying technology is provided by
                EBI and is based on Apache Solr which is a text based search engine.</p>
-
        <p>
                The PDB Sequence Fetcher interface can be opened by selecting <strong>PDB</strong>
                as the choice database from the <strong>'Select Database
                        Retrieval Source'</strong> interface of <a href="seqfetch.html">Sequence
                        Fetcher</a>.
        </p>
-       <br>
-
-       <img src="pdbseqfetcher.png" align="left"
-               alt="PDB sequence fetcher (introduced in Jalview 2.x.x)">
-
-       <br>
        <p>
-               <strong>Searching the PDB Database</strong><br> Once the
-               interface is opened, typing in the search text box will execute a live
-               query to the PDB database and display the results on-the-fly as seen
-               in the screen-shot above. Use the drop-down menu to select a specific
-               field to search by in the PDB database, the default option is <strong>'ALL'</strong>.
-               Furthermore, the PDB search interface also provides the following
-               functionalities:
+               <img src="pdbseqfetcher.png" align="left"
+                       alt="PDB sequence fetcher (introduced in Jalview 2.x.x)">
+       </p>
+
+       <strong>Searching the PDB Database</strong>
+       <br> Once the interface is opened, typing in the search text box
+       will execute a live query to the PDB database and display the results
+       on-the-fly as seen in the screen-shot above. Use the drop-down menu to
+       select a specific field to search by in the PDB database, the default
+       option is
+       <strong>'ALL'</strong>. Furthermore, the PDB search interface also
+       provides the following functionalities:
        <ul>
                <li>Retrieving a unique chain for a PDB entry: <br>To
                        retrieve a specific chain for a PDB entry, append the PDB ID with a