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JAL-3224 JAL-3225 Fixed help image mangling, moved help to help/help and added this...
[jalview.git] / help / html / features / seqmappings.html
diff --git a/help/html/features/seqmappings.html b/help/html/features/seqmappings.html
deleted file mode 100644 (file)
index ce41702..0000000
--- a/help/html/features/seqmappings.html
+++ /dev/null
@@ -1,50 +0,0 @@
-<html>
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
- * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3
- * of the License, or (at your option) any later version.
- *  
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
- * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
- -->
-<head>
-<title>Mapping Between Different Sequences</title>
-</head>
-<body>
-  <p>
-    <strong>Mapping Between Different Sequences</strong>
-  </p>
-  <!--  TODO: review and check if this page is really needed -->
-  <p>A new feature in Jalview 2.3 is the ability to map between
-    sequences in different domains, based on alignment, or by the use of
-    explicit mappings provided by databases.</p>
-  <p>
-    The most familiar mapping is the one used to identify the
-    coordinates corresponding to a displayed sequence when viewing a PDB
-    file associated with a sequence (see <a href="viewingpdbs.html">&quot;Viewing
-      PDB Files&quot;</a> for more information.
-  </p>
-  <p>
-    The newest form of mapping supported by Jalview is the
-    correspondence between DNA and protein sequences. This mapping can
-    be imported directly from EMBL and EMBLCDS database records
-    retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>, and
-    allows sequence features to be mapped directly from UniProt das
-    sources to their coding region on EMBL sequence records.
-  </p>
-  <em><a href="siftsmapping.html">SIFTS Mapping</a> between PDB and
-    UniProt data was introduced in Jalview 2.10</em>
-</body>
-</html>