Including of VARNAv-3.9;
[jalview.git] / help / html / features / varna.html
index f044a44..12d9207 100644 (file)
@@ -39,7 +39,7 @@ associated with the alignment are available.
     Structures associated with the alignment are marked by having "consensus" attached to their name. VARNA contains two different entries for consensus structures.\r
     <ul>\r
       <li>Consensus structure: the individual sequence folded into the consensus structure</li>\r
-      <li>Trimed consensus structure: the individual sequence\r
+      <li>Trimmed consensus structure: the individual sequence\r
        folded into the the gap-free consensus structure. That means all\r
        columns that contained gaps in the individual sequence were\r
        removed. If this breaks a base-pair the pairing is removed also.\r
@@ -60,13 +60,13 @@ associated with the alignment are available.
 <li>Highlighting bases - Move mouse over columns in the Jalview alignment panel</li>\r
 </ul>\r
 \r
-<p><strong>Functionality provided by Jmol</strong></p>\r
+<p><strong>Functionality provided by VARNA</strong></p>\r
 <p>VARNA's own functions are accessed by right-clicking in the\r
 structure display area. That will open the VARNA pop-up menu,\r
 which provides access to a number of features like different draw algorithm, color highlighting or annotations. \r
 </p>\r
 <p><strong>More Information</strong></p>\r
-<p>VARNA is a very powerful RNA viewer on it's own. Only the\r
+<p>VARNA is a very powerful RNA viewer on its own. Only the\r
 essentials have been described here - the interested reader is\r
 referred to <a href="http://varna.lri.fr/usermanual.html">VARNA's own\r
 comprehensive online documentation</a>.</p>\r