JAL-3106 use .jvp as default
[jalview.git] / help / html / releases.html
index 38c0ae3..3dac399 100755 (executable)
@@ -77,6 +77,10 @@ li:before {
         <em></em>
         <ul>
             <li>
+              <!-- JAL-3101 -->Default memory for Jalview webstart and
+              InstallAnywhere increased to 1G.
+            </li>
+            <li>
               <!-- JAL-247 -->Hidden sequence markers and representative
               sequence bolding included when exporting alignment as EPS,
               SVG, PNG or HTML. <em>Display is configured via the
@@ -85,7 +89,7 @@ li:before {
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3076 -->Ensembl client updated to Version 7 REST
-              API and sequence data now imported as JSON
+              API and sequence data now imported as JSON.
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3065 -->Change in recommended way of starting
@@ -107,6 +111,15 @@ li:before {
         <em></em>
         <ul>
             <li>
+              <!-- JAL-3104 -->Poorly scaled bar in quality annotation
+              row shown in Feredoxin Structure alignment view of example
+              alignment.
+            </li>
+            <li>
+              <!-- JAL-2854 -->Annotation obscures sequences if lots of
+              annotation displayed.
+            </li>
+            <li>
               <!-- JAL-3087 -->Corrupted display when switching to
               wrapped mode when sequence panel's vertical scrollbar is
               visible.
@@ -121,22 +134,30 @@ li:before {
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3092 -->Jalview could hang when importing certain
-              types of knotted RNA secondary structure
+              types of knotted RNA secondary structure.
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3095 -->Sequence highlight and selection in
               trimmed VARNA 2D structure is incorrect for sequences that
-              do not start at 1
+              do not start at 1.
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3061 -->'.' inserted into RNA secondary structure
               annotation when columns are inserted into an alignment,
-              and when exporting as Stockolm flatfile.
+              and when exporting as Stockholm flatfile.
             </li>
             <li>
               <!-- JAL-3053 -->Jalview annotation rows containing upper
               and lower-case 'E' and 'H' do not automatically get
-              treated as RNA secondary structure
+              treated as RNA secondary structure.
+            </li>
+            <li>
+              <!-- JAL-3106 -->.jvp should be used as default extension
+              (not .jar) when saving a jalview project file.
+            </li>
+            <li>
+              <!-- JAL-3105 -->Mac Users: closing a window correctly
+              transfers focus to previous window on OSX
             </li>
           </ul>
           <em>Java 10 Issues</em>