JAL-1683 replace year/version strings with tokens in source
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index bf44769..0840768 100644 (file)
@@ -1,38 +1,24 @@
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
- * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
  *  
  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
+ -->
 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
-<!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
- * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
- * 
- * This file is part of Jalview.
- * 
- * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License 
- * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
- * 
- * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
- * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
- * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
- * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
- * 
- * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
--->
 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
 <head>
 Database Reference Fetching
@@ -59,11 +45,11 @@ of ID queries from the ID string of each sequence in the alignment. It
 then tries to query a subset of all the databases it can access in order to match
 the alignment sequence to any records retrieved from the database. If a
 match is found, then the sequence is annotated with that database's
-reference, and any cross-references that it's records contain.</p>
+reference, and any cross-references that its records contain.</p>
 <p><strong>The Sequence Identification Process</strong><br>
 The method of accession id discovery is derived from the method which
 earlier Jalview versions used for Uniprot sequence feature retrieval,
-and was originally restricted to the identifaction of valid Uniprot
+and was originally restricted to the identification of valid Uniprot
 accessions.<br>
 Essentially, Jalview will try to retrieve records from a subset of the databases
 accessible by the <a href="../features/seqfetch.html">sequence