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[jalview.git] / help / html / webServices / mafft.html
diff --git a/help/html/webServices/mafft.html b/help/html/webServices/mafft.html
index 4ee0237..d379e03 100644 (file)
--- a/help/html/webServices/mafft.html
+++ b/help/html/webServices/mafft.html
@@ -1,18 +1,35 @@
-<html>\r
-<head><title>MAFFT Multiple Sequence Alignments</title></head>\r
-<body>\r
-<p><strong>MAFFT Multiple Sequence Alignments</strong></p>\r
-<p> Katoh, K., K. Kuma, K., Toh, H., and Miyata, T. (2005) &quot;MAFFT version \r
-  5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment.&quot; Nucleic Acids \r
-  Research, 33 511-518</p>\r
-<p>MAFFT is a program for the multiple alignment of nucleic acid or protein\r
-sequences, and is available from the <strong>Web\r
-Service&#8594;Alignment&#8594;MAFFT Multiple Sequence\r
-Alignment</strong> entry in the web services menu.</p>\r
-<p>MAFFT utilizes algorithms for spectral correlation to identify\r
-homologous regions in a fast-fourier transform representation of each\r
-sequence. The Jalview web service runs MAFFT using the\r
-'--auto' option which picks optimal parameters\r
-for the set of sequences to be aligned.</p>\r
-</body>\r
-</html>\r
+<html>
+<!--
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
+ * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * 
+ * This file is part of Jalview.
+ * 
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+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
+ * 
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+--!>
+<head><title>MAFFT Multiple Sequence Alignments</title></head>
+<body>
+<p><strong>MAFFT Multiple Sequence Alignments</strong></p>
+<p> Katoh, K., K. Kuma, K., Toh, H., and Miyata, T. (2005) &quot;MAFFT version 
+  5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment.&quot; Nucleic Acids 
+  Research, 33 511-518</p>
+<p>MAFFT is a program for the multiple alignment of nucleic acid or protein
+sequences, and is available from the <strong>Web
+Service&#8594;Alignment&#8594;MAFFT Multiple Sequence
+Alignment</strong> entry in the web services menu.</p>
+<p>MAFFT utilizes algorithms for spectral correlation to identify
+homologous regions in a fast-fourier transform representation of each
+sequence. The Jalview web service runs MAFFT using the
+'--auto' option which picks optimal parameters
+for the set of sequences to be aligned.</p>
+</body>
+</html>