JAL-976 documentation for disorder, AACon, ClustalO services
[jalview.git] / help / html / webServices / msaclient.html
index ecca088..3e6c3cb 100644 (file)
@@ -47,13 +47,13 @@ available:
        <a href="webServicesParams.html">'Edit Settings And Run ..' dialog
                box</a>.
        </p>
-       <p><strong>Alignment programs supported by JABAWS</strong><ul>
-       <li><a href="http://www.clustal.org/">ClustalW</a> (version 2.0.12)</li>
-  <li><a href="http://align.bmr.kyushu-u.ac.jp/mafft/software/">Mafft</a> (version 6.713)</li>
-  <li><a href="http://www.drive5.com/muscle">Muscle</a> (version 3.7) </li>
-  <li><a href="http://www.tcoffee.org/Projects_home_page/t_coffee_home_page.html">Tcoffee</a> (version 8.14) </li>
+       <p><strong>Alignment programs supported by JABAWS</strong>. <br/>Versions shown are those bundled with JABAWS 2.01 - if you are using a different server, check its home page to find out which versions are provided.<ul>
+  <li><a href="http://www.clustal.org/">Clustal Omega and Clustal W</a> (version 2.0.12)</li>
+  <li><a href="http://align.bmr.kyushu-u.ac.jp/mafft/software/">Mafft</a> (version 6.8.57b)</li>
+  <li><a href="http://www.drive5.com/muscle">Muscle</a> (version 3.8.31) </li>
+  <li><a href="http://www.tcoffee.org/Projects_home_page/t_coffee_home_page.html">Tcoffee</a> (version 8.99) </li>
   <li><a href="http://probcons.stanford.edu/">Probcons</a> (version 1.12)</li>
-  </ul>
+       </ul>
 </p>
 
 <p><strong>Multiple Alignments of Sequences with hidden