JAL-2071 further refactoring, optimisation, and house keeping for the generic Free...
[jalview.git] / resources / fts / pdb_data_columns.conf
index 5eebd15..95f2dd1 100644 (file)
@@ -10,97 +10,100 @@ g4;Procedures & Softwares;4
 g5;Date Of;5
 g6;Miscellenous;6
 #
+_data_column.primary_key;pdb_id
+_data_column.default_response_page_size;100
+#
 _data_column.name
 _data_column.code
 _data_column.group_id
+_data_column.data_type
 _data_column.min_col_width
 _data_column.max_col_width
 _data_column.preferred_col_width
-_data_column.is_primary_key
 _data_column.is_shown_by_default
 _data_column.is_searchable
-PDB Id;pdb_id;g2;40;60;45;true;true;true
-Title;title;g6;300;1500;400;false;true;false
-Molecule;molecule_name;g3;50;400;95;false;false;true
-Molecule Type;molecule_type;g3;50;400;95;false;false;true
-Sequence;molecule_sequence;g6;50;400;95;false;false;false
-PFAM Accession;pfam_accession;g2;50;400;95;false;false;true
-PFAM Name;pfam_name;g3;50;400;95;false;false;true
-InterPro Name;interpro_name;g3;50;400;95;false;false;false
-InterPro Accession;interpro_accession;g2;50;400;95;false;false;false
-UniProt Id;uniprot_id;g2;50;400;95;false;false;true
-UniProt Accession;uniprot_accession;g2;50;400;95;false;false;false
-UniProt Coverage;uniprot_coverage;g6;50;400;95;false;false;false
-Uniprot Features;uniprot_features;g6;50;400;95;false;false;false
-R Factor;r_factor;g1;50;150;85;false;false;false
-Resolution;resolution;g1;50;150;85;false;true;false
-Data Quality;data_quality;g1;50;150;85;false;false;false
-Overall Quality;overall_quality;g1;50;150;85;false;false;false
-Number of Polymers;number_of_polymers;g6;50;400;95;false;false;false
-Number of Protein Chains;number_of_protein_chains;g6;50;400;95;false;false;false
-Number of Bound Molecule;number_of_bound_molecules;g6;50;400;95;false;false;false
-Number of Polymer Residue;number_of_polymer_residues;g6;50;400;95;false;false;false
-GENUS;genus;g3;50;400;95;false;false;true
-Gene Name;gene_name;g3;50;400;95;false;false;true
-Experimental Method;experimental_method;g4;50;400;95;false;false;false
-GO Id;go_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Assembly Id;assembly_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Assembly Form;assembly_form;g6;50;400;95;false;false;false
-Assembly Type;assembly_type;g6;50;400;95;false;false;false
-Space Group;spacegroup;g6;50;400;95;false;false;false
-Cath Code;cath_code;g2;50;400;95;false;false;false
-Tax Id;tax_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Tax Query;tax_query;g2;50;400;95;false;false;false
-Interacting Entity Id;interacting_entity_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Interacting Molecules;interacting_molecules;g6;50;400;95;false;false;false
-Pubmed Id;pubmed_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Status;status;g6;50;400;95;false;false;false
-Model Quality;model_quality;g1;50;150;85;false;false;false
-Pivot Resolution;pivot_resolution;g1;50;150;85;false;false;false
-Data reduction software;data_reduction_software;g4;50;400;95;false;false;false
-Max observed residues;max_observed_residues;g6;50;400;95;false;false;false
-Organism scientific name;organism_scientific_name;g3;50;400;95;false;false;false
-Super kingdom;superkingdom;g3;50;400;95;false;false;false
-Rank;rank;g3;50;400;95;false;false;false
-Crystallisation Ph;crystallisation_ph;g6;50;400;95;false;false;false
-Biological Function;biological_function;g6;50;400;95;false;false;false
-Biological Process;biological_process;g6;50;400;95;false;false;false
-Biological Cell Component;biological_cell_component;g6;50;400;95;false;false;false
-Compound Name;compound_name;g3;50;400;95;false;false;false
-Compound Id;compound_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Compound Weight;compound_weight;g6;50;400;95;false;false;false
-Compound Systematic Name;compound_systematic_name;g3;50;400;95;false;false;false
-Interacting Ligands;interacting_ligands;g6;50;400;95;false;false;false
-Journal;journal;g6;50;400;95;false;false;false
-All Authors;all_authors;g6;50;400;95;false;false;false
-Experiment Data Available;experiment_data_available;g6;50;400;95;false;false;false
-Diffraction Protocol;diffraction_protocol;g4;50;400;95;false;false;false
-Refinement Software;refinement_software;g4;50;400;95;false;false;false
-Structure Determination Method;structure_determination_method;g4;50;400;95;false;false;false
-Synchrotron Site;synchrotron_site;g6;50;400;95;false;false;false
-Sample Preparation Method;sample_preparation_method;g4;50;400;95;false;false;false
-Entry Authors;entry_authors;g6;50;400;95;false;false;false
-Citation Title;citation_title;g6;50;400;95;false;false;false
-Structure Solution Software;structure_solution_software;g4;50;400;95;false;false;false
-Entry Entity;entry_entity;g6;50;400;95;false;false;false
-R Free;r_free;g1;50;150;85;false;false;false
-Number of Polymer Entities;number_of_polymer_entities;g6;50;400;95;false;false;false
-Number of Bound Entities;number_of_bound_entities;g6;50;400;95;false;false;false
-Crystallisation Reservoir;crystallisation_reservoir;g6;50;400;95;false;false;false
-Data Scalling Software;data_scaling_software;g4;50;400;95 ;false;false;false
-Detector;detector;g6;50;400;95;false;false;false
-Detector Type;detector_type;g6;50;400;95;false;false;false
-Modified Residue Flag;modified_residue_flag;g6;50;400;95;false;false;false
-Number of Copies;number_of_copies;g6;50;400;95;false;false;false
-Struc Asym Id;struct_asym_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Homologus PDB Entity Id;homologus_pdb_entity_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Molecule Synonym;molecule_synonym;g6;50;400;95;false;false;false
-Deposition Site;deposition_site;g6;50;400;95;false;false;false
-Synchrotron Beamline;synchrotron_beamline;g6;50;400;95;false;false;false
-Entity Id; entity_id;g2;50;400;95;false;false;false
-Beam Source Name;beam_source_name;g3;50;400;95;false;false;false
-Processing Site;processing_site;g6;50;400;95;false;false;false
-Entity Weight;entity_weight;g6;50;400;95;false;false;false
-Version;_version_;g6;50;400;95;false;false;false
-ALL;text;g6;50;400;95;false;false;true
+PDB Id;pdb_id;String;g2;40;60;45;true;true
+Title;title;String;g6;300;1500;400;true;false
+Molecule;molecule_name;String;g3;50;400;95;false;true
+Molecule Type;molecule_type;String;g3;50;400;95;false;true
+Sequence;molecule_sequence;String;g6;50;400;95;false;false
+PFAM Accession;pfam_accession;String;g2;50;400;95;false;true
+PFAM Name;pfam_name;String;g3;50;400;95;false;true
+InterPro Name;interpro_name;String;g3;50;400;95;false;false
+InterPro Accession;interpro_accession;String;g2;50;400;95;false;false
+UniProt Id;uniprot_id;String;g2;50;400;95;false;true
+UniProt Accession;uniprot_accession;String;g2;50;400;95;false;false
+UniProt Coverage;uniprot_coverage;String;g6;50;400;95;false;false
+Uniprot Features;uniprot_features;String;g6;50;400;95;false;false
+R Factor;r_factor;Double;g1;50;150;85;false;false
+Resolution;resolution;Double;g1;50;150;85;true;false
+Data Quality;data_quality;Double;g1;50;150;85;false;false
+Overall Quality;overall_quality;Double;g1;50;150;85;false;false
+Number of Polymers;number_of_polymers;int;g6;50;400;95;false;false
+Number of Protein Chains;number_of_protein_chains;int;g6;50;400;95;false;false
+Number of Bound Molecule;number_of_bound_molecules;int;g6;50;400;95;false;false
+Number of Polymer Residue;number_of_polymer_residues;int;g6;50;400;95;false;false
+GENUS;genus;String;g3;50;400;95;false;true
+Gene Name;gene_name;String;g3;50;400;95;false;true
+Experimental Method;experimental_method;String;g4;50;400;95;false;false
+GO Id;go_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Assembly Id;assembly_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Assembly Form;assembly_form;String;g6;50;400;95;false;false
+Assembly Type;assembly_type;String;g6;50;400;95;false;false
+Space Group;spacegroup;String;g6;50;400;95;false;false
+Cath Code;cath_code;String;g2;50;400;95;false;false
+Tax Id;tax_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Tax Query;tax_query;String;g2;50;400;95;false;false
+Interacting Entity Id;interacting_entity_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Interacting Molecules;interacting_molecules;String;g6;50;400;95;false;false
+Pubmed Id;pubmed_id;int;g2;50;400;95;false;false
+Status;status;String;g6;50;400;95;false;false
+Model Quality;model_quality;Double;g1;50;150;85;false;false
+Pivot Resolution;pivot_resolution;Double;g1;50;150;85;false;false
+Data reduction software;data_reduction_software;String;g4;50;400;95;false;false
+Max observed residues;max_observed_residues;String;g6;50;400;95;false;false
+Organism scientific name;organism_scientific_name;String;g3;50;400;95;false;false
+Super kingdom;superkingdom;String;g3;50;400;95;false;false
+Rank;rank;String;g3;50;400;95;false;false
+Crystallisation Ph;crystallisation_ph;String;g6;50;400;95;false;false
+Biological Function;biological_function;String;g6;50;400;95;false;false
+Biological Process;biological_process;String;g6;50;400;95;false;false
+Biological Cell Component;biological_cell_component;String;g6;50;400;95;false;false
+Compound Name;compound_name;String;g3;50;400;95;false;false
+Compound Id;compound_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Compound Weight;compound_weight;String;g6;50;400;95;false;false
+Compound Systematic Name;compound_systematic_name;String;g3;50;400;95;false;false
+Interacting Ligands;interacting_ligands;String;g6;50;400;95;false;false
+Journal;journal;String;g6;50;400;95;false;false
+All Authors;all_authors;String;g6;50;400;95;false;false
+Experiment Data Available;experiment_data_available;String;g6;50;400;95;false;false
+Diffraction Protocol;diffraction_protocol;String;g4;50;400;95;false;false
+Refinement Software;refinement_software;String;g4;50;400;95;false;false
+Structure Determination Method;structure_determination_method;String;g4;50;400;95;false;false
+Synchrotron Site;synchrotron_site;String;g6;50;400;95;false;false
+Sample Preparation Method;sample_preparation_method;String;g4;50;400;95;false;false
+Entry Authors;entry_authors;String;g6;50;400;95;false;false
+Citation Title;citation_title;String;g6;50;400;95;false;false
+Structure Solution Software;structure_solution_software;String;g4;50;400;95;false;false
+Entry Entity;entry_entity;String;g6;50;400;95;false;false
+R Free;r_free;Double;g1;50;150;85;false;false
+Number of Polymer Entities;number_of_polymer_entities;int;g6;50;400;95;false;false
+Number of Bound Entities;number_of_bound_entities;int;g6;50;400;95;false;false
+Crystallisation Reservoir;crystallisation_reservoir;String;g6;50;400;95;false;false
+Data Scalling Software;data_scaling_software;String;g4;50;400;95;false;false
+Detector;detector;String;g6;50;400;95;false;false
+Detector Type;detector_type;String;g6;50;400;95;false;false
+Modified Residue Flag;modified_residue_flag;String;g6;50;400;95;false;false
+Number of Copies;number_of_copies;int;g6;50;400;95;false;false
+Struc Asym Id;struct_asym_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Homologus PDB Entity Id;homologus_pdb_entity_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Molecule Synonym;molecule_synonym;String;g6;50;400;95;false;false
+Deposition Site;deposition_site;String;g6;50;400;95;false;false
+Synchrotron Beamline;synchrotron_beamline;String;g6;50;400;95;false;false
+Entity Id; entity_id;String;g2;50;400;95;false;false
+Beam Source Name;beam_source_name;String;g3;50;400;95;false;false
+Processing Site;processing_site;String;g6;50;400;95;false;false
+Entity Weight;entity_weight;Double;g6;50;400;95;false;false
+Version;_version_;String;g6;50;400;95;false;false
+ALL;text;String;g6;50;400;95;false;true
 #