Merge branch 'develop' into features/JAL-1812_JAL-2083_groovyBinding
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
index 6bd4d4e..c9d9e94 100644 (file)
@@ -675,7 +675,7 @@ label.view_all_representative_structures = View all {0} representative structure
 label.open_new_jmol_view_with_all_representative_structures_associated_current_selection_superimpose_using_alignment = Opens a new structure viewer with all representative structures\nassociated with the current selection\nsuperimposed with the current alignment.
 label.associate_structure_with_sequence = Associate Structure with Sequence
 label.from_file = From File
-label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
+label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (Note: Specific chains can be retrieved by appending the chain code to the PDB Id delimited with a colon i.e. 1abc:X)
 label.discover_pdb_ids = Discover PDB IDs
 label.text_colour = Text Colour
 action.set_text_colour = Text Colour...
@@ -801,6 +801,8 @@ label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot i
 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
 label.select_columns_containing = Select columns containing
 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
+label.hide_columns_containing = Hide columns containing
+label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
 label.use_sequence_id_1 = Use $SEQUENCE_ID$ or $SEQUENCE_ID=/<regex>/=$
@@ -1026,7 +1028,7 @@ error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: nee
 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
-label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} containing features of type {3}  across {4} sequence(s)
+label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns containing features of type {2}  across {3} sequence(s)
 label.toggled = Toggled
 label.marked = Marked
 label.not = not
@@ -1278,22 +1280,31 @@ label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
-exception.pdb_rest_service_no_longer_available = PDB rest services no longer available!
+exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
-exception.pdb_server_error = There seems to be an error from the PDB server
-exception.pdb_server_unreachable = Jalview is unable to reach the PDBe Solr server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
+exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
+exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
-label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
-status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file.
-status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation.
-info.error_creating_file = Error creating {0} file.
+status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
+status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
+info.error_creating_file = Error creating {0} file
 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
-info.error_creating_file = Error creating {0} file.
 label.run_groovy = Run Groovy console script
 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
 action.next_page= >> 
-action.prev_page= << 
\ No newline at end of file
+action.prev_page= << 
+label.next_page_tooltip=Next Page
+label.prev_page_tooltip=Previous Page
+exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
+exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
+status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
+status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
+status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
+status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
+status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
+status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
+status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file