Merge branch 'develop' into features/JAL-3010ontologyFeatureSettings
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
index a23bc00..205da8e 100644 (file)
@@ -30,7 +30,9 @@ action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
 action.close_all = Close all
 action.load_project = Load Project
 action.save_project = Save Project
+action.save_project_as = Save Project as...
 action.quit = Quit
+label.quit_jalview = Quit Jalview?
 action.expand_views = Expand Views
 action.gather_views = Gather Views
 action.page_setup = Page Setup...
@@ -168,10 +170,9 @@ label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
 label.choose_calculation = Choose Calculation
-label.treecalc_title = {0} Using {1}
+label.calc_title = {0} Using {1}
 label.tree_calc_av = Average Distance
 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
-label.select_score_model = Select score model
 label.score_model_pid = % Identity
 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
 label.score_model_pam250 = PAM 250
@@ -184,21 +185,22 @@ label.out_to_textbox = Output to Textbox
 label.occupancy = Occupancy
 # delete Clustal - use FileFormat name instead
 label.clustal = Clustal
-# label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
+# label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
 label.colourScheme_clustal = Clustalx
 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
-label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
+label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
 label.colourScheme_zappo = Zappo
 label.colourScheme_taylor = Taylor
 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
-label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
-label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
-label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
-label.colourScheme_buried_index = Buried Index
+label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
+label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
+label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
+label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
-label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
-label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
+label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
+label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
+label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
 label.blc = BLC
 label.fasta = Fasta
 label.msf = MSF
@@ -407,7 +409,7 @@ label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
 label.input_alignment = Input Alignment
 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
-label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
+label.couldnt_locate = Could not locate {0}
 label.url_not_found = URL not found
 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
@@ -491,6 +493,10 @@ label.edit_name_description = Edit Name/Description...
 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
 label.edit_sequence = Edit Sequence
 label.edit_sequences = Edit Sequences
+label.insert_gap = Insert 1 gap
+label.insert_gaps = Insert {0} gaps
+label.delete_gap = Delete 1 gap
+label.delete_gaps = Delete {0} gaps
 label.sequence_details = Sequence Details
 label.jmol_help = Jmol Help
 label.chimera_help = Chimera Help
@@ -752,7 +758,7 @@ label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
 label.view_documentation = View documentation
 label.select_return_type = Select return type
-label.translation_of_params = Translation of {0}
+label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
 label.features_for_params = Features for - {0}
 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
@@ -795,6 +801,7 @@ label.rest_client_submit = {0} using {1}
 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
+label.feature_settings_select_columns = Double click to select columns containing feature
 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
@@ -992,7 +999,8 @@ label.toggled = Toggled
 label.marked = Marked
 label.containing = containing
 label.not_containing = not containing
-label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
+label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
+label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
 label.submission_params = Submission {0}
 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
@@ -1219,9 +1227,6 @@ label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
-exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
-exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
-exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
@@ -1238,8 +1243,6 @@ action.next_page= >>
 action.prev_page= << 
 label.next_page_tooltip=Next Page
 label.prev_page_tooltip=Previous Page
-exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
-exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
@@ -1255,7 +1258,6 @@ label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Conne
 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
 label.do_not_display_again = Do not display this message again
 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
-label.filter = Filter text:
 action.customfilter = Custom only
 action.showall = Show All
 label.insert = Insert:
@@ -1308,6 +1310,7 @@ label.numeric_required = The value should be numeric
 label.filter = Filter
 label.filters = Filters
 label.join_conditions = Join conditions with
+label.delete_condition = Delete this condition
 label.score = Score
 label.colour_by_label = Colour by label
 label.variable_colour = Variable colour...
@@ -1322,7 +1325,6 @@ label.colour_by_text = Colour by text
 label.graduated_colour = Graduated Colour
 label.by_text_of = By text of
 label.by_range_of = By range of
-label.filters_tooltip = Click to set or amend filters
 label.or = Or
 label.and = And
 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
@@ -1333,3 +1335,73 @@ label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
 label.cached_structures = Cached Structures
 label.free_text_search = Free Text Search
+label.summary_view = Summary View
+label.group_by_so = Group features by Sequence Ontology
+label.apply_to_subtypes = Apply to features and sub-types of
+label.apply_also_to = Apply also to:
+label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
+label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
+label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
+label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
+label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
+label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
+label.backups = Backups
+label.backup = Backup
+label.backup_files = Backup Files
+label.enable_backupfiles = Enable backup files
+label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
+label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
+label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
+label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
+label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
+label.scheme_examples = Scheme examples
+label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
+label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
+label.keep_files = Deleting old backup files
+label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
+label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
+label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
+label.always_ask = Always ask
+label.auto_delete = Automatically delete
+label.filename = filename
+label.braced_oldest = (oldest)
+label.braced_newest = (most recent)
+label.configuration = Configuration
+label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
+label.schemes = Schemes
+label.customise = Customise
+label.custom = Custom
+label.default = Default
+label.single_file = Single backup
+label.keep_all_versions = Keep all versions
+label.rolled_backups = Rolled backup files
+label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
+label.custom_description = Your own saved scheme
+label.default_description = Keep the last three versions of the file
+label.single_file_description = Keep the last version of the file
+label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
+label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
+label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
+label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
+label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
+label.include_backup_files = Include backup files
+label.cancel_changes = Cancel changes
+label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
+label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
+label.was_previous = was {0}
+label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
+label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
+label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
+label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
+label.delete = Delete
+label.rename = Rename
+label.keep = Keep
+label.file_info = (modified {0}, size {1})
+label.annotation_name = Annotation Name
+label.annotation_description = Annotation Description 
+label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
+label.alignment = alignment
+label.pca = PCA
+label.create_image_of = Create {0} image of {1}
+label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
+label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu