JAL-3551 pull up Close Viewer dialog to base class
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
index 2d48fac..8747588 100644 (file)
@@ -132,6 +132,8 @@ tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(
 action.deselect_all = Deselect all
 action.invert_selection = Invert selection
 action.using_jmol = Using Jmol
+action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
+action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
 action.link = Link
 action.group_link = Group Link
 action.show_chain = Show Chain
@@ -185,22 +187,22 @@ label.out_to_textbox = Output to Textbox
 label.occupancy = Occupancy
 # delete Clustal - use FileFormat name instead
 label.clustal = Clustal
-# label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
+# label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
 label.colourScheme_clustal = Clustalx
 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
-label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
+label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
 label.colourScheme_zappo = Zappo
 label.colourScheme_taylor = Taylor
 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
-label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
-label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
-label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
-label.colourScheme_buried_index = Buried Index
+label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
+label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
+label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
+label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
-label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
-label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
-label.colourScheme_sequence_id = Sequence ID Colour
+label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
+label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
+label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
 label.blc = BLC
 label.fasta = Fasta
 label.msf = MSF
@@ -228,6 +230,7 @@ label.nucleotide = Nucleotide
 label.protein = Protein
 label.nucleotides = Nucleotides
 label.proteins = Proteins
+label.CDS = CDS
 label.to_new_alignment = To New Alignment
 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
@@ -265,11 +268,11 @@ label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
 label.structure_viewer = Default structure viewer
 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
-label.chimera_path = Path to Chimera program
-label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
-label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
-label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
-label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
+label.viewer_path = Path to {0} program
+label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
+label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
+label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
+label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
 label.min_colour = Minimum Colour
 label.max_colour = Maximum Colour
 label.no_colour = No Colour
@@ -501,7 +504,7 @@ label.sequence_details = Sequence Details
 label.jmol_help = Jmol Help
 label.chimera_help = Chimera Help
 label.close_viewer = Close Viewer
-label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
+label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
 label.all = All
 label.sort_by = Sort alignment by
 label.sort_by_score = Sort by Score
@@ -620,7 +623,6 @@ label.editing = Editing
 label.web_services = Web Services
 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
-label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
@@ -707,7 +709,8 @@ label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
 label.link_name = Link Name
 label.pdb_file = PDB file
 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
-label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
+label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
+label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
 label.superpose_structures = Superpose Structures
 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
@@ -765,6 +768,9 @@ label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
 label.varna_params = VARNA - {0}
 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
+label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
+label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
+label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
 label.points_for_params = Points for {0}
@@ -998,7 +1004,8 @@ label.toggled = Toggled
 label.marked = Marked
 label.containing = containing
 label.not_containing = not containing
-label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
+label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
+label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
 label.submission_params = Submission {0}
 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
@@ -1122,7 +1129,7 @@ status.fetching_db_refs = Fetching db refs
 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
 status.opening_file_for = opening file for
-status.colouring_chimera = Colouring Chimera
+status.colouring_structures = Colouring structures
 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
 label.font_too_small = Font size is too small
 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
@@ -1225,9 +1232,6 @@ label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
-exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
-exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
-exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
@@ -1244,8 +1248,6 @@ action.next_page= >>
 action.prev_page= << 
 label.next_page_tooltip=Next Page
 label.prev_page_tooltip=Previous Page
-exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
-exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
@@ -1313,6 +1315,7 @@ label.numeric_required = The value should be numeric
 label.filter = Filter
 label.filters = Filters
 label.join_conditions = Join conditions with
+label.delete_condition = Delete this condition
 label.score = Score
 label.colour_by_label = Colour by label
 label.variable_colour = Variable colour...
@@ -1352,12 +1355,13 @@ label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup numb
 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
+label.scheme_examples = Scheme examples
 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
 label.keep_files = Deleting old backup files
 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
-label.autodelete_old_backup_files = Autodelete old backup files:
+label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
 label.always_ask = Always ask
 label.auto_delete = Automatically delete
 label.filename = filename
@@ -1367,10 +1371,18 @@ label.configuration = Configuration
 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
 label.schemes = Schemes
 label.customise = Customise
+label.custom = Custom
 label.default = Default
 label.single_file = Single backup
 label.keep_all_versions = Keep all versions
 label.rolled_backups = Rolled backup files
+label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
+label.custom_description = Your own saved scheme
+label.default_description = Keep the last three versions of the file
+label.single_file_description = Keep the last version of the file
+label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
+label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
+label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
 label.include_backup_files = Include backup files
@@ -1394,3 +1406,9 @@ label.pca = PCA
 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
+label.show_linked_features = Show {0} features
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+label.include_linked_features = Include {0} features
+label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
+label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
+label.no_features_to_sort_by = No features to sort by