git://source.jalview.org / jalview.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
JAL-3438 spotless for 2.11.2.0
[jalview.git] / src / ext / vamsas / JpredSoapBindingStub.java
diff --git a/src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java b/src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java
index 47a39dc..7c7f8e7 100755 (executable)
--- a/src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java
+++ b/src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java
@@ -1,20 +1,22 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)
- * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
- * This program is free software; you can redistribute it and/or
- * modify it under the terms of the GNU General Public License
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2
- * of the License, or (at your option) any later version.
+ * This file is part of Jalview.
  * 
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
- * GNU General Public License for more details.
+ * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License 
+ * as published by the Free Software Foundation, either version 3
+ * of the License, or (at your option) any later version.
+ *  
+ * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
+ * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
+ * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
+ * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  * 
  * You should have received a copy of the GNU General Public License
- * along with this program; if not, write to the Free Software
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
+ * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+ * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  */
 package ext.vamsas;
 
@@ -44,7 +46,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     oper.setName("predict");
     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
-                    "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
+                    "Sequence"),
+            vamsas.objects.simple.Sequence.class,
             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
@@ -64,8 +67,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
-    oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
-            "predictOnMsaReturn"));
+    oper.setReturnQName(
+            new javax.xml.namespace.QName("", "predictOnMsaReturn"));
     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
     _operations[1] = oper;
@@ -80,8 +83,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
             "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
-    oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
-            "getpredictReturn"));
+    oper.setReturnQName(
+            new javax.xml.namespace.QName("", "getpredictReturn"));
     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
     _operations[2] = oper;
@@ -96,9 +99,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
             "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
-    oper
-            .setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
-                    "getresultReturn"));
+    oper.setReturnQName(
+            new javax.xml.namespace.QName("", "getresultReturn"));
     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
     _operations[3] = oper;
@@ -157,7 +159,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     cachedSerFactories.add(beansf);
     cachedDeserFactories.add(beandf);
 
-    qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
+    qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
+            "Result");
     cachedSerQNames.add(qName);
     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
     cachedSerClasses.add(cls);
@@ -237,8 +240,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
         if (firstCall())
         {
           // must set encoding style before registering serializers
-          _call
-                  .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
+          _call.setSOAPVersion(
+                  org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
           {
@@ -272,15 +275,14 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     _call.setOperation(_operations[0]);
     _call.setUseSOAPAction(true);
     _call.setSOAPActionURI("");
-    _call
-            .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
-    _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
-            "predict"));
+    _call.setSOAPVersion(
+            org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
+    _call.setOperationName(
+            new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "predict"));
 
     setRequestHeaders(_call);
     setAttachments(_call);
-    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
-    { seq });
+    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { seq });
 
     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
     {
@@ -294,8 +296,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
         return (java.lang.String) _resp;
       } catch (java.lang.Exception _exception)
       {
-        return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
-                _resp, java.lang.String.class);
+        return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils
+                .convert(_resp, java.lang.String.class);
       }
     }
   }
@@ -312,15 +314,14 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     _call.setOperation(_operations[1]);
     _call.setUseSOAPAction(true);
     _call.setSOAPActionURI("");
-    _call
-            .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
-    _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
-            "predictOnMsa"));
+    _call.setSOAPVersion(
+            org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
+    _call.setOperationName(
+            new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "predictOnMsa"));
 
     setRequestHeaders(_call);
     setAttachments(_call);
-    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
-    { msf });
+    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { msf });
 
     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
     {
@@ -334,8 +335,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
         return (java.lang.String) _resp;
       } catch (java.lang.Exception _exception)
       {
-        return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
-                _resp, java.lang.String.class);
+        return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils
+                .convert(_resp, java.lang.String.class);
       }
     }
   }
@@ -351,15 +352,16 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     _call.setOperation(_operations[2]);
     _call.setUseSOAPAction(true);
     _call.setSOAPActionURI("");
-    _call
-            .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
-    _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
-            "getpredict"));
+    _call.setSOAPVersion(
+            org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
+    _call.setOperationName(
+            new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getpredict"));
 
     setRequestHeaders(_call);
     setAttachments(_call);
-    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
-    { job_id });
+    java.lang.Object _resp = _call
+            .invoke(new java.lang.Object[]
+            { job_id });
 
     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
     {
@@ -379,8 +381,8 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     }
   }
 
-  public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
-          throws java.rmi.RemoteException
+  public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(
+          java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
   {
     if (super.cachedEndpoint == null)
     {
@@ -390,15 +392,16 @@ public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
     _call.setOperation(_operations[3]);
     _call.setUseSOAPAction(true);
     _call.setSOAPActionURI("");
-    _call
-            .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
-    _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
-            "getresult"));
+    _call.setSOAPVersion(
+            org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
+    _call.setOperationName(
+            new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getresult"));
 
     setRequestHeaders(_call);
     setAttachments(_call);
-    java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
-    { job_id });
+    java.lang.Object _resp = _call
+            .invoke(new java.lang.Object[]
+            { job_id });
 
     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
     {