JAL-1807 explicit imports (jalview.appletgui)
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / AnnotationLabels.java
index 67faf11..c490fba 100755 (executable)
  */
 package jalview.appletgui;
 
+import jalview.analysis.AlignmentUtils;
+import jalview.bin.JalviewLite;
+import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
+import jalview.datamodel.Annotation;
+import jalview.datamodel.SequenceGroup;
+import jalview.datamodel.SequenceI;
+import jalview.util.MessageManager;
+import jalview.util.ParseHtmlBodyAndLinks;
+
 import java.awt.Checkbox;
 import java.awt.CheckboxMenuItem;
 import java.awt.Color;
@@ -44,14 +53,6 @@ import java.util.Arrays;
 import java.util.Collections;
 import java.util.Vector;
 
-import jalview.analysis.AlignmentUtils;
-import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
-import jalview.datamodel.Annotation;
-import jalview.datamodel.SequenceGroup;
-import jalview.datamodel.SequenceI;
-import jalview.util.MessageManager;
-import jalview.util.ParseHtmlBodyAndLinks;
-
 public class AnnotationLabels extends Panel implements ActionListener,
         MouseListener, MouseMotionListener
 {
@@ -200,7 +201,7 @@ public class AnnotationLabels extends Panel implements ActionListener,
               ap.alignFrame);
       Frame frame = new Frame();
       frame.add(cap);
-      jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, ap.alignFrame.getTitle()
+      JalviewLite.addFrame(frame, ap.alignFrame.getTitle()
               + " - " + aa[selectedRow].label, 500, 100);
       cap.setText(aa[selectedRow].toString());
     }
@@ -766,16 +767,16 @@ public class AnnotationLabels extends Panel implements ActionListener,
     {
       return;
     }
-    jalview.appletgui.AlignFrame.copiedSequences = new StringBuffer();
-    jalview.appletgui.AlignFrame.copiedSequences.append(sq.getName() + "\t"
+    AlignFrame.copiedSequences = new StringBuffer();
+    AlignFrame.copiedSequences.append(sq.getName() + "\t"
             + sq.getStart() + "\t" + sq.getEnd() + "\t"
             + sq.getSequenceAsString() + "\n");
     if (av.hasHiddenColumns())
     {
-      jalview.appletgui.AlignFrame.copiedHiddenColumns = new Vector();
+      AlignFrame.copiedHiddenColumns = new Vector();
       for (int[] region : av.getColumnSelection().getHiddenColumns())
       {
-        jalview.appletgui.AlignFrame.copiedHiddenColumns
+        AlignFrame.copiedHiddenColumns
                 .addElement(new int[]
                 { region[0], region[1] });
       }