formatting
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / TreePanel.java
index ec2512f..28d101c 100644 (file)
@@ -41,6 +41,7 @@ public class TreePanel extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
   TreeCanvas treeCanvas;
 
   NJTree tree;
+
   AlignmentPanel ap;
 
   AlignViewport av;
@@ -49,10 +50,11 @@ public class TreePanel extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
   {
     return tree;
   }
-  
-  public void finalize() throws Throwable {
-    ap=null;
-    av=null;
+
+  public void finalize() throws Throwable
+  {
+    ap = null;
+    av = null;
     super.finalize();
   }
 
@@ -199,9 +201,8 @@ public class TreePanel extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
       {
         int start, end;
         SequenceI[] seqs;
-        boolean selview=(av
-                .getSelectionGroup() != null) && (av
-                .getSelectionGroup().getSize()>1);
+        boolean selview = (av.getSelectionGroup() != null)
+                && (av.getSelectionGroup().getSize() > 1);
         AlignmentView seqStrings = av.getAlignmentView(selview);
         if (!selview)
         {
@@ -213,7 +214,8 @@ public class TreePanel extends EmbmenuFrame implements ActionListener,
         {
           start = av.getSelectionGroup().getStartRes();
           end = av.getSelectionGroup().getEndRes() + 1;
-          seqs = av.getSelectionGroup().getSequencesInOrder(av.getAlignment());
+          seqs = av.getSelectionGroup().getSequencesInOrder(
+                  av.getAlignment());
         }
 
         tree = new NJTree(seqs, seqStrings, type, pwtype, start, end);