Create instance of FormatAdapter
[jalview.git] / src / jalview / bin / JalviewLite.java
index c9ec391..75f5991 100755 (executable)
@@ -107,7 +107,7 @@ public class JalviewLite extends Applet
       }\r
 \r
       String format = jalview.io.IdentifyFile.Identify(args[0],"File");\r
-      SequenceI[] sequences = FormatAdapter.readFile(args[0], "File", format);\r
+      SequenceI[] sequences = new FormatAdapter().readFile(args[0], "File", format);\r
 \r
       if ( (sequences != null) && (sequences.length > 0))\r
       {\r
@@ -228,7 +228,7 @@ public class JalviewLite extends Applet
         public void run()\r
         {\r
             SequenceI[] sequences = null;\r
-            sequences = FormatAdapter.readFile(file, protocol, format);\r
+            sequences = new FormatAdapter().readFile(file, protocol, format);\r
 \r
             if ((sequences != null) && (sequences.length > 0))\r
             {\r