after merge
[jalview.git] / src / jalview / binding / Feature.java
diff --git a/src/jalview/binding/Feature.java b/src/jalview/binding/Feature.java
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..95d5192
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,305 @@
+/*\r
+ * This class was automatically generated with \r
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
+ * Schema.\r
+ * $Id$\r
+ */\r
+\r
+package jalview.binding;\r
+\r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
+//---------------------------------/\r
+\r
+import java.io.IOException;\r
+import java.io.Reader;\r
+import java.io.Serializable;\r
+import java.io.Writer;\r
+import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
+import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
+import org.xml.sax.ContentHandler;\r
+\r
+/**\r
+ * Class Feature.\r
+ * \r
+ * @version $Revision$ $Date$\r
+ */\r
+public class Feature implements java.io.Serializable {\r
+\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
+    //--------------------------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _begin\r
+     */\r
+    private int _begin;\r
+\r
+    /**\r
+     * keeps track of state for field: _begin\r
+     */\r
+    private boolean _has_begin;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _end\r
+     */\r
+    private int _end;\r
+\r
+    /**\r
+     * keeps track of state for field: _end\r
+     */\r
+    private boolean _has_end;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _type\r
+     */\r
+    private java.lang.String _type;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _description\r
+     */\r
+    private java.lang.String _description;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _status\r
+     */\r
+    private java.lang.String _status;\r
+\r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
+    //----------------/\r
+\r
+    public Feature() {\r
+        super();\r
+    } //-- jalview.binding.Feature()\r
+\r
+\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Method deleteBegin\r
+     * \r
+     */\r
+    public void deleteBegin()\r
+    {\r
+        this._has_begin= false;\r
+    } //-- void deleteBegin() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method deleteEnd\r
+     * \r
+     */\r
+    public void deleteEnd()\r
+    {\r
+        this._has_end= false;\r
+    } //-- void deleteEnd() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'begin'.\r
+     * \r
+     * @return int\r
+     * @return the value of field 'begin'.\r
+     */\r
+    public int getBegin()\r
+    {\r
+        return this._begin;\r
+    } //-- int getBegin() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'description'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'description'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getDescription()\r
+    {\r
+        return this._description;\r
+    } //-- java.lang.String getDescription() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'end'.\r
+     * \r
+     * @return int\r
+     * @return the value of field 'end'.\r
+     */\r
+    public int getEnd()\r
+    {\r
+        return this._end;\r
+    } //-- int getEnd() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'status'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'status'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getStatus()\r
+    {\r
+        return this._status;\r
+    } //-- java.lang.String getStatus() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'type'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'type'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getType()\r
+    {\r
+        return this._type;\r
+    } //-- java.lang.String getType() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method hasBegin\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return boolean\r
+     */\r
+    public boolean hasBegin()\r
+    {\r
+        return this._has_begin;\r
+    } //-- boolean hasBegin() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method hasEnd\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return boolean\r
+     */\r
+    public boolean hasEnd()\r
+    {\r
+        return this._has_end;\r
+    } //-- boolean hasEnd() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method isValid\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return boolean\r
+     */\r
+    public boolean isValid()\r
+    {\r
+        try {\r
+            validate();\r
+        }\r
+        catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+            return false;\r
+        }\r
+        return true;\r
+    } //-- boolean isValid() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method marshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param out\r
+     */\r
+    public void marshal(java.io.Writer out)\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
+        Marshaller.marshal(this, out);\r
+    } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method marshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param handler\r
+     */\r
+    public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
+        Marshaller.marshal(this, handler);\r
+    } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'begin'.\r
+     * \r
+     * @param begin the value of field 'begin'.\r
+     */\r
+    public void setBegin(int begin)\r
+    {\r
+        this._begin = begin;\r
+        this._has_begin = true;\r
+    } //-- void setBegin(int) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'description'.\r
+     * \r
+     * @param description the value of field 'description'.\r
+     */\r
+    public void setDescription(java.lang.String description)\r
+    {\r
+        this._description = description;\r
+    } //-- void setDescription(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'end'.\r
+     * \r
+     * @param end the value of field 'end'.\r
+     */\r
+    public void setEnd(int end)\r
+    {\r
+        this._end = end;\r
+        this._has_end = true;\r
+    } //-- void setEnd(int) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'status'.\r
+     * \r
+     * @param status the value of field 'status'.\r
+     */\r
+    public void setStatus(java.lang.String status)\r
+    {\r
+        this._status = status;\r
+    } //-- void setStatus(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'type'.\r
+     * \r
+     * @param type the value of field 'type'.\r
+     */\r
+    public void setType(java.lang.String type)\r
+    {\r
+        this._type = type;\r
+    } //-- void setType(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method unmarshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param reader\r
+     * @return Object\r
+     */\r
+    public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        return (jalview.binding.Feature) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.Feature.class, reader);\r
+    } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method validate\r
+     * \r
+     */\r
+    public void validate()\r
+        throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
+        validator.validate(this);\r
+    } //-- void validate() \r
+\r
+}\r