2.08, not 2.07
[jalview.git] / src / jalview / binding / JalviewModel.java
index 85bfe26..8edd012 100755 (executable)
@@ -1,55 +1,37 @@
 /*\r
- * This class was automatically generated with\r
+ * This class was automatically generated with \r
  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
  * Schema.\r
  * $Id$\r
  */\r
-/*\r
-* Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
-*\r
-* This program is free software; you can redistribute it and/or\r
-* modify it under the terms of the GNU General Public License\r
-* as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
-* of the License, or (at your option) any later version.\r
-*\r
-* This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
-* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
-* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
-* GNU General Public License for more details.\r
-*\r
-* You should have received a copy of the GNU General Public License\r
-* along with this program; if not, write to the Free Software\r
-* Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
-*/\r
-package jalview.binding;\r
-\r
-import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
-import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
-import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
-import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
 \r
-import org.xml.sax.ContentHandler;\r
+package jalview.binding;\r
 \r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
-//- Imported classes and packages -/\r
-//---------------------------------/\r
+\r
 import java.io.IOException;\r
 import java.io.Reader;\r
 import java.io.Serializable;\r
 import java.io.Writer;\r
-\r
 import java.util.Date;\r
-\r
+import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
+import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
+import org.xml.sax.ContentHandler;\r
 \r
 /**\r
  * Class JalviewModel.\r
- *\r
+ * \r
  * @version $Revision$ $Date$\r
  */\r
 public class JalviewModel implements java.io.Serializable {\r
-    //--------------------------/\r
-    //- Class/Member Variables -/\r
+\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
     //--------------------------/\r
 \r
     /**\r
@@ -58,6 +40,11 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
     private java.util.Date _creationDate;\r
 \r
     /**\r
+     * Field _version\r
+     */\r
+    private java.lang.String _version;\r
+\r
+    /**\r
      * Field _vamsasModel\r
      */\r
     private jalview.binding.VamsasModel _vamsasModel;\r
@@ -67,143 +54,174 @@ public class JalviewModel implements java.io.Serializable {
      */\r
     private jalview.binding.JalviewModelSequence _jalviewModelSequence;\r
 \r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
     //----------------/\r
-    //- Constructors -/\r
-    //----------------/\r
+\r
     public JalviewModel() {\r
         super();\r
-    }\r
-     //-- jalview.binding.JalviewModel()\r
- //-----------/\r
+    } //-- jalview.binding.JalviewModel()\r
+\r
 \r
-    public java.util.Date getCreationDate() {\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'creationDate'.\r
+     * \r
+     * @return Date\r
+     * @return the value of field 'creationDate'.\r
+     */\r
+    public java.util.Date getCreationDate()\r
+    {\r
         return this._creationDate;\r
-    }\r
-     //-- java.util.Date getCreationDate()\r
+    } //-- java.util.Date getCreationDate() \r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
-     *\r
+     * \r
      * @return JalviewModelSequence\r
      * @return the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
      */\r
-    public jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence() {\r
+    public jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()\r
+    {\r
         return this._jalviewModelSequence;\r
-    }\r
-     //-- jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence()\r
+    } //-- jalview.binding.JalviewModelSequence getJalviewModelSequence() \r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'vamsasModel'.\r
-     *\r
+     * \r
      * @return VamsasModel\r
      * @return the value of field 'vamsasModel'.\r
      */\r
-    public jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel() {\r
+    public jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel()\r
+    {\r
         return this._vamsasModel;\r
-    }\r
-     //-- jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel()\r
+    } //-- jalview.binding.VamsasModel getVamsasModel() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'version'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'version'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getVersion()\r
+    {\r
+        return this._version;\r
+    } //-- java.lang.String getVersion() \r
 \r
     /**\r
      * Method isValid\r
-     *\r
-     *\r
-     *\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
      * @return boolean\r
      */\r
-    public boolean isValid() {\r
+    public boolean isValid()\r
+    {\r
         try {\r
             validate();\r
-        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+        }\r
+        catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
             return false;\r
         }\r
-\r
         return true;\r
-    }\r
-     //-- boolean isValid()\r
+    } //-- boolean isValid() \r
 \r
     /**\r
      * Method marshal\r
-     *\r
-     *\r
-     *\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
      * @param out\r
      */\r
     public void marshal(java.io.Writer out)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
-            org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
         Marshaller.marshal(this, out);\r
-    }\r
-     //-- void marshal(java.io.Writer)\r
+    } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
 \r
     /**\r
      * Method marshal\r
-     *\r
-     *\r
-     *\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
      * @param handler\r
      */\r
     public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
-            org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
         Marshaller.marshal(this, handler);\r
-    }\r
-     //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler)\r
+    } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'creationDate'.\r
-     *\r
+     * \r
      * @param creationDate the value of field 'creationDate'.\r
      */\r
-    public void setCreationDate(java.util.Date creationDate) {\r
+    public void setCreationDate(java.util.Date creationDate)\r
+    {\r
         this._creationDate = creationDate;\r
-    }\r
-     //-- void setCreationDate(java.util.Date)\r
+    } //-- void setCreationDate(java.util.Date) \r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'jalviewModelSequence'.\r
-     *\r
+     * \r
      * @param jalviewModelSequence the value of field\r
      * 'jalviewModelSequence'.\r
      */\r
-    public void setJalviewModelSequence(\r
-        jalview.binding.JalviewModelSequence jalviewModelSequence) {\r
+    public void setJalviewModelSequence(jalview.binding.JalviewModelSequence jalviewModelSequence)\r
+    {\r
         this._jalviewModelSequence = jalviewModelSequence;\r
-    }\r
-     //-- void setJalviewModelSequence(jalview.binding.JalviewModelSequence)\r
+    } //-- void setJalviewModelSequence(jalview.binding.JalviewModelSequence) \r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'vamsasModel'.\r
-     *\r
+     * \r
      * @param vamsasModel the value of field 'vamsasModel'.\r
      */\r
-    public void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel vamsasModel) {\r
+    public void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel vamsasModel)\r
+    {\r
         this._vamsasModel = vamsasModel;\r
-    }\r
-     //-- void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel)\r
+    } //-- void setVamsasModel(jalview.binding.VamsasModel) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'version'.\r
+     * \r
+     * @param version the value of field 'version'.\r
+     */\r
+    public void setVersion(java.lang.String version)\r
+    {\r
+        this._version = version;\r
+    } //-- void setVersion(java.lang.String) \r
 \r
     /**\r
      * Method unmarshal\r
-     *\r
-     *\r
-     *\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
      * @param reader\r
      * @return Object\r
      */\r
     public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, \r
-            org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
-        return (jalview.binding.JalviewModel) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JalviewModel.class,\r
-            reader);\r
-    }\r
-     //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader)\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        return (jalview.binding.JalviewModel) Unmarshaller.unmarshal(jalview.binding.JalviewModel.class, reader);\r
+    } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
 \r
     /**\r
      * Method validate\r
-     *\r
+     * \r
      */\r
-    public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+    public void validate()\r
+        throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
         validator.validate(this);\r
-    }\r
-     //-- void validate()\r
+    } //-- void validate() \r
+\r
 }\r