JAL-1551 spotlessApply
[jalview.git] / src / jalview / datamodel / SeqDistanceContactMatrix.java
index ec19b25..89daeb2 100644 (file)
@@ -14,9 +14,12 @@ import jalview.ws.datamodel.alphafold.MappableContactMatrix;
  * @author jprocter
  *
  */
-public class SeqDistanceContactMatrix extends MappableContactMatrix<SeqDistanceContactMatrix> implements ContactMatrixI
+public class SeqDistanceContactMatrix
+        extends MappableContactMatrix<SeqDistanceContactMatrix>
+        implements ContactMatrixI
 {
   private static final String SEQUENCE_DISTANCE = "SEQUENCE_DISTANCE";
+
   private int width = 0;
 
   public SeqDistanceContactMatrix(int width)
@@ -82,6 +85,7 @@ public class SeqDistanceContactMatrix extends MappableContactMatrix<SeqDistanceC
       }
     });
   }
+
   @Override
   public String getAnnotDescr()
   {
@@ -111,17 +115,18 @@ public class SeqDistanceContactMatrix extends MappableContactMatrix<SeqDistanceC
   {
     return width;
   }
+
   @Override
   protected double getElementAt(int _column, int i)
   {
-    return Math.abs(_column-i);
+    return Math.abs(_column - i);
   }
 
   @Override
   protected SeqDistanceContactMatrix newMappableContactMatrix(
           SequenceI newRefSeq, MapList newFromMapList)
   {
-    
+
     return new SeqDistanceContactMatrix(width);
   }
 }