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[jalview.git] / src / jalview / gui / OptsAndParamsPage.java
diff --git a/src/jalview/gui/OptsAndParamsPage.java b/src/jalview/gui/OptsAndParamsPage.java
index 0f6126c..a45fe1b 100644 (file)
--- a/src/jalview/gui/OptsAndParamsPage.java
+++ b/src/jalview/gui/OptsAndParamsPage.java
@@ -169,7 +169,8 @@ public class OptsAndParamsPage
       }
       else
       {
-        notmod &= (initVal!=null) ? initVal.equals(val.getSelectedItem()) : val.getSelectedItem()!=initVal;
+        notmod &= (initVal != null) ? initVal.equals(val.getSelectedItem())
+                : val.getSelectedItem() != initVal;
       }
       poparent.argSetModified(this, !notmod);
     }
@@ -181,16 +182,20 @@ public class OptsAndParamsPage
         return null;
       }
       OptionI opt = option.copy();
-      if (opt.getPossibleValues()!=null && opt.getPossibleValues().size()==1)
+      if (opt.getPossibleValues() != null
+              && opt.getPossibleValues().size() == 1)
       {
-        // Hack to make sure the default value for an enabled option with only one value is actually returned
+        // Hack to make sure the default value for an enabled option with only
+        // one value is actually returned
         opt.setValue(opt.getPossibleValues().get(0));
       }
       if (val.getSelectedItem() != null)
       {
         opt.setValue((String) val.getSelectedItem());
-      } else {
-        if (option.getValue()!=null)
+      }
+      else
+      {
+        if (option.getValue() != null)
         {
           opt.setValue(option.getValue());
         }
@@ -250,7 +255,7 @@ public class OptsAndParamsPage
       }
       else
       {
-        initVal = (initEnabled) ? (String)val.getSelectedItem() : null;
+        initVal = (initEnabled) ? (String) val.getSelectedItem() : null;
       }
     }
 
@@ -310,7 +315,7 @@ public class OptsAndParamsPage
           choice = true;
         }
       }
-      
+
       if (!compact)
       {
         makeExpanderParam(parm);
@@ -324,9 +329,9 @@ public class OptsAndParamsPage
 
     private void makeCompactParam(ParameterI parm)
     {
-      setLayout(new MigLayout("","[][grow]"));
+      setLayout(new MigLayout("", "[][grow]"));
 
-      String ttipText=null;
+      String ttipText = null;
 
       controlPanel.setLayout(new BorderLayout());
 
@@ -335,14 +340,16 @@ public class OptsAndParamsPage
       {
         // Only create description boxes if there actually is a description.
         ttipText = ("<html>"
-                  + JvSwingUtils
-                          .wrapTooltip(parm.getDescription()+(finfo!=null ?"<br><img src=\""
-                                  + linkImageURL
-                                  + "\"/> Right click for further information.":""))
-                  + "</html>");
+                + JvSwingUtils
+                        .wrapTooltip(parm.getDescription()
+                                + (finfo != null ? "<br><img src=\""
+                                        + linkImageURL
+                                        + "\"/> Right click for further information."
+                                        : "")) + "</html>");
       }
-      
-      JvSwingUtils.mgAddtoLayout(this, ttipText, new JLabel(parm.getName()),controlPanel, "");
+
+      JvSwingUtils.mgAddtoLayout(this, ttipText,
+              new JLabel(parm.getName()), controlPanel, "");
       updateControls(parm);
       validate();
     }
@@ -575,21 +582,21 @@ public class OptsAndParamsPage
           valueField.addActionListener(this);
           valueField.addKeyListener(new KeyListener()
           {
-            
+
             @Override
             public void keyTyped(KeyEvent e)
             {
             }
-            
+
             @Override
             public void keyReleased(KeyEvent e)
             {
-              if (valueField.getText().trim().length()>0)
-                {
+              if (valueField.getText().trim().length() > 0)
+              {
                 actionPerformed(null);
-                }
+              }
             }
-            
+
             @Override
             public void keyPressed(KeyEvent e)
             {
@@ -661,7 +668,7 @@ public class OptsAndParamsPage
           }
           ;
           // update value field to reflect any bound checking we performed.
-          valueField.setText(""+iVal);
+          valueField.setText("" + iVal);
           if (validator.getMin() != null && validator.getMax() != null)
           {
             slider.getModel().setRangeProperties(iVal, 1,
@@ -689,7 +696,7 @@ public class OptsAndParamsPage
               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
               // this parameter
               // update value field to reflect any bound checking we performed.
-              valueField.setText(""+fVal);
+              valueField.setText("" + fVal);
             }
             if (validator.getMax() != null
                     && validator.getMax().floatValue() < fVal)
@@ -698,7 +705,7 @@ public class OptsAndParamsPage
               // TODO: provide visual indication that hard limit was reached for
               // this parameter
               // update value field to reflect any bound checking we performed.
-              valueField.setText(""+fVal);
+              valueField.setText("" + fVal);
             }
           } catch (Exception e)
           {
@@ -744,12 +751,14 @@ public class OptsAndParamsPage
 
   public OptsAndParamsPage(OptsParametersContainerI paramContainer)
   {
-    this(paramContainer,false);
+    this(paramContainer, false);
   }
-  public OptsAndParamsPage(OptsParametersContainerI paramContainer, boolean compact)
+
+  public OptsAndParamsPage(OptsParametersContainerI paramContainer,
+          boolean compact)
   {
     poparent = paramContainer;
-    this.compact=compact;
+    this.compact = compact;
   }
 
   public static void showUrlPopUp(JComponent invoker, final String finfo,