JAL-2110 JAL-2131 JAL-1765 remove reference to jalview.datamodel.Alignment from Align...
[jalview.git] / src / jalview / gui / TreePanel.java
index d78350d..fafa610 100755 (executable)
@@ -520,8 +520,8 @@ public class TreePanel extends GTreePanel
     {
       // AlignmentOrder origorder = new AlignmentOrder(alAndColsel[0]);
 
-      Alignment al = new Alignment((SequenceI[]) alAndColsel[0]);
-      Alignment dataset = (av != null && av.getAlignment() != null) ? av
+      AlignmentI al = new Alignment((SequenceI[]) alAndColsel[0]);
+      AlignmentI dataset = (av != null && av.getAlignment() != null) ? av
               .getAlignment().getDataset() : null;
       if (dataset != null)
       {