fileFormat enum wip changes
[jalview.git] / src / jalview / io / AlignmentFileI.java
index bee36f6..1a000a3 100644 (file)
@@ -17,15 +17,13 @@ public interface AlignmentFileI
 
   void setNewlineString(String newline);
 
-  void addJVSuffix(boolean jvsuffix);
-
   void setExportSettings(AlignExportSettingI exportSettings);
 
   void configureForView(AlignmentViewPanel viewpanel);
 
   void setSeqs(SequenceI[] sequencesArray);
 
-  String print();
+  String print(SequenceI[] seqs, boolean jvsuffix);
 
   boolean hasWarningMessage();