JAL-1270 JUnit to TestNG refactoring
[jalview.git] / src / jalview / io / BLCFile.java
index 0376c2c..c7cf2d6 100755 (executable)
  */
 package jalview.io;
 
-import java.io.*;
-import java.util.*;
+import jalview.datamodel.Sequence;
+import jalview.datamodel.SequenceI;
 
-import jalview.datamodel.*;
+import java.io.IOException;
+import java.util.Vector;
 
 /**
  * DOCUMENT ME!
@@ -115,7 +116,9 @@ public class BLCFile extends AlignFile
       {
         line = nextLine();
         if (line == null)
+        {
           break;
+        }
         // seek end of ids
         if (line.indexOf("*") > -1)
         {
@@ -150,7 +153,9 @@ public class BLCFile extends AlignFile
         }
       } while (!idsFound);
       if (line == null)
+       {
         break; // end of file.
+      }
       int starCol = line.indexOf("*");
       seqstrings = new StringBuffer[seqs.size()];
 
@@ -198,9 +203,11 @@ public class BLCFile extends AlignFile
     }
     if (seqs.size() > 0)
     {
-      if (headerLines.length() > 1 + numHeaderLines) // could see if buffer is
+      if (headerLines.length() > 1 + numHeaderLines)
+      {
         // just whitespace or not.
         setAlignmentProperty("Comments", headerLines.toString());
+      }
       setAlignmentProperty("iteration", "" + iterationCount);
     }
   }