JAL-4090 JAL-1551 spotlessApply
[jalview.git] / src / jalview / io / FeaturesFile.java
index a704f24..38e27f9 100755 (executable)
@@ -312,7 +312,8 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
       // should report somewhere useful for UI if necessary
       warningMessage = ((warningMessage == null) ? "" : warningMessage)
               + "Parsing error at\n" + line;
-      jalview.bin.Console.outPrintln("Error parsing feature file: " + ex + "\n" + line);
+      jalview.bin.Console.outPrintln(
+              "Error parsing feature file: " + ex + "\n" + line);
       ex.printStackTrace(System.err);
       resetMatcher();
       return false;
@@ -354,8 +355,8 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
       String[] tokens = line.split(TAB_REGEX);
       if (tokens.length != 2)
       {
-        jalview.bin.Console.errPrintln(String.format("Invalid token count %d for %d",
-                tokens.length, line));
+        jalview.bin.Console.errPrintln(String.format(
+                "Invalid token count %d for %d", tokens.length, line));
       }
       else
       {
@@ -415,7 +416,8 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
         seq = alignment.getSequenceAt(idx);
       } catch (NumberFormatException ex)
       {
-        jalview.bin.Console.errPrintln("Invalid sequence index: " + seqIndex);
+        jalview.bin.Console
+                .errPrintln("Invalid sequence index: " + seqIndex);
       }
     }
 
@@ -1009,7 +1011,8 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
   @Override
   public String print(SequenceI[] sqs, boolean jvsuffix)
   {
-    jalview.bin.Console.outPrintln("Use printGffFormat() or printJalviewFormat()");
+    jalview.bin.Console
+            .outPrintln("Use printGffFormat() or printJalviewFormat()");
     return null;
   }
 
@@ -1333,8 +1336,9 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
      */
     if (gffColumns.length < 5)
     {
-      jalview.bin.Console.errPrintln("Ignoring GFF feature line with too few columns ("
-              + gffColumns.length + ")");
+      jalview.bin.Console
+              .errPrintln("Ignoring GFF feature line with too few columns ("
+                      + gffColumns.length + ")");
       return null;
     }
 
@@ -1364,7 +1368,8 @@ public class FeaturesFile extends AlignFile implements FeaturesSourceI
         }
       } catch (IOException e)
       {
-        jalview.bin.Console.errPrintln("GFF parsing failed with: " + e.getMessage());
+        jalview.bin.Console
+                .errPrintln("GFF parsing failed with: " + e.getMessage());
         return null;
       }
     }