spelling err
[jalview.git] / src / jalview / io / JalviewFileFilter.java
index e2692e2..3252a98 100755 (executable)
 /*\r
-* Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
-* Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
-*\r
-* This program is free software; you can redistribute it and/or\r
-* modify it under the terms of the GNU General Public License\r
-* as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
-* of the License, or (at your option) any later version.\r
-*\r
-* This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
-* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
-* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
-* GNU General Public License for more details.\r
-*\r
-* You should have received a copy of the GNU General Public License\r
-* along with this program; if not, write to the Free Software\r
-* Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
-*/\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
+ * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ *\r
+ * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
+ * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
+ * of the License, or (at your option) any later version.\r
+ *\r
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
+ * GNU General Public License for more details.\r
+ *\r
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
+ * along with this program; if not, write to the Free Software\r
+ * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
+ */\r
 package jalview.io;\r
 \r
-import java.io.File;\r
-\r
+import java.io.*;\r
 import java.util.*;\r
 \r
-import javax.swing.filechooser.*;\r
-\r
+import javax.swing.filechooser.FileFilter;\r
 \r
-public class JalviewFileFilter extends FileFilter {\r
-    private static String TYPE_UNKNOWN = "Type Unknown";\r
-    private static String HIDDEN_FILE = "Hidden File";\r
-    public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();\r
-    private Hashtable filters = null;\r
-    private String description = "no description";\r
-    private String fullDescription = "full description";\r
-    private boolean useExtensionsInDescription = true;\r
+public class JalviewFileFilter\r
+    extends FileFilter\r
+{\r
+  public static Hashtable suffixHash = new Hashtable();\r
+  private Hashtable filters = null;\r
+  private String description = "no description";\r
+  private String fullDescription = "full description";\r
+  private boolean useExtensionsInDescription = true;\r
 \r
-    public JalviewFileFilter(String extension, String description) {\r
-        StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");\r
+  public JalviewFileFilter(String extension, String description)\r
+  {\r
+    StringTokenizer st = new StringTokenizer(extension, ",");\r
 \r
-        while (st.hasMoreElements()) {\r
-            addExtension(st.nextToken().trim());\r
-        }\r
-\r
-        setDescription(description);\r
+    while (st.hasMoreElements())\r
+    {\r
+      addExtension(st.nextToken().trim());\r
     }\r
 \r
-    public JalviewFileFilter(String[] filts) {\r
-        this(filts, null);\r
-    }\r
+    setDescription(description);\r
+  }\r
 \r
-    public JalviewFileFilter(String[] filts, String description) {\r
-        for (int i = 0; i < filts.length; i++) {\r
-            // add filters one by one\r
-            addExtension(filts[i]);\r
-        }\r
+  public JalviewFileFilter(String[] filts)\r
+  {\r
+    this(filts, null);\r
+  }\r
 \r
-        if (description != null) {\r
-            setDescription(description);\r
-        }\r
+  public JalviewFileFilter(String[] filts, String description)\r
+  {\r
+    for (int i = 0; i < filts.length; i++)\r
+    {\r
+      // add filters one by one\r
+      addExtension(filts[i]);\r
     }\r
 \r
-    public String getAcceptableExtension() {\r
-        return filters.keys().nextElement().toString();\r
+    if (description != null)\r
+    {\r
+      setDescription(description);\r
     }\r
-\r
-    // takes account of the fact that database is a directory\r
-    public boolean accept(File f) {\r
-        if (f != null) {\r
-            String extension = getExtension(f);\r
-\r
-            if (f.isDirectory()) {\r
-                if ((extension == null) || extension.equals("")) {\r
-                    return true;\r
-                } else {\r
-                    if (filters.get(getExtension(f)) != null) {\r
-                        return true;\r
-                    }\r
-                }\r
-            }\r
-\r
-            if ((extension != null) && (filters.get(getExtension(f)) != null)) {\r
-                return true;\r
-            }\r
-        }\r
-\r
-        return false;\r
+  }\r
+\r
+  public String getAcceptableExtension()\r
+  {\r
+    return filters.keys().nextElement().toString();\r
+  }\r
+\r
+  // takes account of the fact that database is a directory\r
+  public boolean accept(File f)\r
+  {\r
+    if (f != null)\r
+    {\r
+      String extension = getExtension(f);\r
+\r
+      if (f.isDirectory())\r
+      {\r
+          return true;\r
+      }\r
+\r
+      if ( (extension != null) && (filters.get(getExtension(f)) != null))\r
+      {\r
+        return true;\r
+      }\r
     }\r
 \r
-    public String getExtension(File f) {\r
-        if (f != null) {\r
-            String filename = f.getName();\r
-            int i = filename.lastIndexOf('.');\r
+    return false;\r
+  }\r
 \r
-            if ((i > 0) && (i < (filename.length() - 1))) {\r
-                return filename.substring(i + 1).toLowerCase();\r
-            }\r
+  public String getExtension(File f)\r
+  {\r
+    if (f != null)\r
+    {\r
+      String filename = f.getName();\r
+      int i = filename.lastIndexOf('.');\r
 \r
-            ;\r
-        }\r
+      if ( (i > 0) && (i < (filename.length() - 1)))\r
+      {\r
+        return filename.substring(i + 1).toLowerCase();\r
+      }\r
 \r
-        return "";\r
+      ;\r
     }\r
 \r
-    public void addExtension(String extension) {\r
-        if (filters == null) {\r
-            filters = new Hashtable(5);\r
-        }\r
+    return "";\r
+  }\r
 \r
-        filters.put(extension.toLowerCase(), this);\r
-        fullDescription = null;\r
+  public void addExtension(String extension)\r
+  {\r
+    if (filters == null)\r
+    {\r
+      filters = new Hashtable(5);\r
     }\r
 \r
-    public String getDescription() {\r
-        if (fullDescription == null) {\r
-            if ((description == null) || isExtensionListInDescription()) {\r
-                fullDescription = (description == null) ? "(" : (description +\r
-                    " (");\r
-\r
-                // build the description from the extension list\r
-                Enumeration extensions = filters.keys();\r
-\r
-                if (extensions != null) {\r
-                    fullDescription += ("." +\r
-                    (String) extensions.nextElement());\r
-\r
-                    while (extensions.hasMoreElements()) {\r
-                        fullDescription += (", " +\r
-                        (String) extensions.nextElement());\r
-                    }\r
-                }\r
-\r
-                fullDescription += ")";\r
-            } else {\r
-                fullDescription = description;\r
-            }\r
+    filters.put(extension.toLowerCase(), this);\r
+    fullDescription = null;\r
+  }\r
+\r
+  public String getDescription()\r
+  {\r
+    if (fullDescription == null)\r
+    {\r
+      if ( (description == null) || isExtensionListInDescription())\r
+      {\r
+        fullDescription = (description == null) ? "(" : (description +\r
+            " (");\r
+\r
+        // build the description from the extension list\r
+        Enumeration extensions = filters.keys();\r
+\r
+        if (extensions != null)\r
+        {\r
+          fullDescription += ("." +\r
+                              (String) extensions.nextElement());\r
+\r
+          while (extensions.hasMoreElements())\r
+          {\r
+            fullDescription += (", " +\r
+                                (String) extensions.nextElement());\r
+          }\r
         }\r
 \r
-        return fullDescription;\r
-    }\r
-\r
-    public void setDescription(String description) {\r
-        this.description = description;\r
-        fullDescription = null;\r
-    }\r
-\r
-    public void setExtensionListInDescription(boolean b) {\r
-        useExtensionsInDescription = b;\r
-        fullDescription = null;\r
+        fullDescription += ")";\r
+      }\r
+      else\r
+      {\r
+        fullDescription = description;\r
+      }\r
     }\r
 \r
-    public boolean isExtensionListInDescription() {\r
-        return useExtensionsInDescription;\r
-    }\r
+    return fullDescription;\r
+  }\r
+\r
+  public void setDescription(String description)\r
+  {\r
+    this.description = description;\r
+    fullDescription = null;\r
+  }\r
+\r
+  public void setExtensionListInDescription(boolean b)\r
+  {\r
+    useExtensionsInDescription = b;\r
+    fullDescription = null;\r
+  }\r
+\r
+  public boolean isExtensionListInDescription()\r
+  {\r
+    return useExtensionsInDescription;\r
+  }\r
 }\r