JAL-1807 explicit imports (jalview.io.*)
[jalview.git] / src / jalview / io / TCoffeeScoreFile.java
index ca8a22a..4f94be9 100644 (file)
@@ -25,6 +25,7 @@ import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
 import jalview.datamodel.AlignmentI;
 import jalview.datamodel.Annotation;
 import jalview.datamodel.SequenceI;
+import jalview.util.Comparison;
 
 import java.awt.Color;
 import java.io.IOException;
@@ -592,7 +593,7 @@ public class TCoffeeScoreFile extends AlignFile
       for (int j = 0; j < jSize; j++)
       {
         byte val = srow[j];
-        if (s != null && jalview.util.Comparison.isGap(s.getCharAt(j)))
+        if (s != null && Comparison.isGap(s.getCharAt(j)))
         {
           annotations[j] = null;
           if (val > 0)