Saves Jmol status
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / Pdbentry.java
index f4fa4fe..93c2748 100755 (executable)
@@ -1,5 +1,5 @@
 /*\r
- * This class was automatically generated with\r
+ * This class was automatically generated with \r
  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
  * Schema.\r
  * $Id$\r
 \r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
-//- Imported classes and packages -/\r
-//---------------------------------/\r
-\r
-import java.util.*;\r
 \r
-import org.exolab.castor.xml.*;\r
+import java.io.IOException;\r
+import java.io.Reader;\r
+import java.io.Serializable;\r
+import java.io.Writer;\r
+import java.util.Enumeration;\r
+import java.util.Vector;\r
+import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
+import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
+import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
+import org.xml.sax.ContentHandler;\r
 \r
 /**\r
  * Class Pdbentry.\r
- *\r
+ * \r
  * @version $Revision$ $Date$\r
  */\r
-public class Pdbentry\r
-    implements java.io.Serializable\r
-{\r
-\r
-  //--------------------------/\r
-  //- Class/Member Variables -/\r
-  //--------------------------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _id\r
-   */\r
-  private java.lang.String _id;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _type\r
-   */\r
-  private java.lang.String _type;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _file\r
-   */\r
-  private java.lang.String _file;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _items\r
-   */\r
-  private java.util.Vector _items;\r
-\r
-  //----------------/\r
-  //- Constructors -/\r
-  //----------------/\r
-\r
-  public Pdbentry()\r
-  {\r
-    super();\r
-    _items = new Vector();\r
-  } //-- jalview.schemabinding.version2.Pdbentry()\r
-\r
-  //-----------/\r
-  //- Methods -/\r
-  //-----------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Method addPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param vPdbentryItem\r
-   */\r
-  public void addPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem\r
-                              vPdbentryItem)\r
-      throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
-  {\r
-    _items.addElement(vPdbentryItem);\r
-  } //-- void addPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method addPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param index\r
-   * @param vPdbentryItem\r
-   */\r
-  public void addPdbentryItem(int index,\r
-                              jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem\r
-                              vPdbentryItem)\r
-      throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
-  {\r
-    _items.insertElementAt(vPdbentryItem, index);\r
-  } //-- void addPdbentryItem(int, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method enumeratePdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @return Enumeration\r
-   */\r
-  public java.util.Enumeration enumeratePdbentryItem()\r
-  {\r
-    return _items.elements();\r
-  } //-- java.util.Enumeration enumeratePdbentryItem()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'file'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'file'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getFile()\r
-  {\r
-    return this._file;\r
-  } //-- java.lang.String getFile()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'id'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'id'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getId()\r
-  {\r
-    return this._id;\r
-  } //-- java.lang.String getId()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method getPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param index\r
-   * @return PdbentryItem\r
-   */\r
-  public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem getPdbentryItem(int index)\r
-      throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
-  {\r
-    //-- check bounds for index\r
-    if ( (index < 0) || (index > _items.size()))\r
+public class Pdbentry implements java.io.Serializable {\r
+\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
+    //--------------------------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _id\r
+     */\r
+    private java.lang.String _id;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _type\r
+     */\r
+    private java.lang.String _type;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _file\r
+     */\r
+    private java.lang.String _file;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _items\r
+     */\r
+    private java.util.Vector _items;\r
+\r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
+    //----------------/\r
+\r
+    public Pdbentry() {\r
+        super();\r
+        _items = new Vector();\r
+    } //-- jalview.schemabinding.version2.Pdbentry()\r
+\r
+\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Method addPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param vPdbentryItem\r
+     */\r
+    public void addPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem vPdbentryItem)\r
+        throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
+    {\r
+        _items.addElement(vPdbentryItem);\r
+    } //-- void addPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method addPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param index\r
+     * @param vPdbentryItem\r
+     */\r
+    public void addPdbentryItem(int index, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem vPdbentryItem)\r
+        throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
+    {\r
+        _items.insertElementAt(vPdbentryItem, index);\r
+    } //-- void addPdbentryItem(int, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method enumeratePdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return Enumeration\r
+     */\r
+    public java.util.Enumeration enumeratePdbentryItem()\r
+    {\r
+        return _items.elements();\r
+    } //-- java.util.Enumeration enumeratePdbentryItem() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'file'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'file'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getFile()\r
+    {\r
+        return this._file;\r
+    } //-- java.lang.String getFile() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'id'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'id'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getId()\r
+    {\r
+        return this._id;\r
+    } //-- java.lang.String getId() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method getPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param index\r
+     * @return PdbentryItem\r
+     */\r
+    public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem getPdbentryItem(int index)\r
+        throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
+    {\r
+        //-- check bounds for index\r
+        if ((index < 0) || (index > _items.size())) {\r
+            throw new IndexOutOfBoundsException();\r
+        }\r
+        \r
+        return (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) _items.elementAt(index);\r
+    } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem getPdbentryItem(int) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method getPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return PdbentryItem\r
+     */\r
+    public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] getPdbentryItem()\r
+    {\r
+        int size = _items.size();\r
+        jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] mArray = new jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[size];\r
+        for (int index = 0; index < size; index++) {\r
+            mArray[index] = (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) _items.elementAt(index);\r
+        }\r
+        return mArray;\r
+    } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] getPdbentryItem() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method getPdbentryItemCount\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return int\r
+     */\r
+    public int getPdbentryItemCount()\r
+    {\r
+        return _items.size();\r
+    } //-- int getPdbentryItemCount() \r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'type'.\r
+     * \r
+     * @return String\r
+     * @return the value of field 'type'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getType()\r
+    {\r
+        return this._type;\r
+    } //-- java.lang.String getType() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method isValid\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @return boolean\r
+     */\r
+    public boolean isValid()\r
+    {\r
+        try {\r
+            validate();\r
+        }\r
+        catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+            return false;\r
+        }\r
+        return true;\r
+    } //-- boolean isValid() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method marshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param out\r
+     */\r
+    public void marshal(java.io.Writer out)\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
+        Marshaller.marshal(this, out);\r
+    } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method marshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param handler\r
+     */\r
+    public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
+    {\r
+        \r
+        Marshaller.marshal(this, handler);\r
+    } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method removeAllPdbentryItem\r
+     * \r
+     */\r
+    public void removeAllPdbentryItem()\r
+    {\r
+        _items.removeAllElements();\r
+    } //-- void removeAllPdbentryItem() \r
+\r
+    /**\r
+     * Method removePdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param index\r
+     * @return PdbentryItem\r
+     */\r
+    public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem removePdbentryItem(int index)\r
+    {\r
+        java.lang.Object obj = _items.elementAt(index);\r
+        _items.removeElementAt(index);\r
+        return (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) obj;\r
+    } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem removePdbentryItem(int) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'file'.\r
+     * \r
+     * @param file the value of field 'file'.\r
+     */\r
+    public void setFile(java.lang.String file)\r
+    {\r
+        this._file = file;\r
+    } //-- void setFile(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'id'.\r
+     * \r
+     * @param id the value of field 'id'.\r
+     */\r
+    public void setId(java.lang.String id)\r
     {\r
-      throw new IndexOutOfBoundsException();\r
-    }\r
-\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) _items.elementAt(index);\r
-  } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem getPdbentryItem(int)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method getPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @return PdbentryItem\r
-   */\r
-  public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] getPdbentryItem()\r
-  {\r
-    int size = _items.size();\r
-    jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] mArray = new jalview.\r
-        schemabinding.version2.PdbentryItem[size];\r
-    for (int index = 0; index < size; index++)\r
+        this._id = id;\r
+    } //-- void setId(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method setPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param index\r
+     * @param vPdbentryItem\r
+     */\r
+    public void setPdbentryItem(int index, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem vPdbentryItem)\r
+        throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
     {\r
-      mArray[index] = (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) _items.\r
-          elementAt(index);\r
-    }\r
-    return mArray;\r
-  } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] getPdbentryItem()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method getPdbentryItemCount\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @return int\r
-   */\r
-  public int getPdbentryItemCount()\r
-  {\r
-    return _items.size();\r
-  } //-- int getPdbentryItemCount()\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'type'.\r
-   *\r
-   * @return String\r
-   * @return the value of field 'type'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getType()\r
-  {\r
-    return this._type;\r
-  } //-- java.lang.String getType()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method isValid\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @return boolean\r
-   */\r
-  public boolean isValid()\r
-  {\r
-    try\r
+        //-- check bounds for index\r
+        if ((index < 0) || (index > _items.size())) {\r
+            throw new IndexOutOfBoundsException();\r
+        }\r
+        _items.setElementAt(vPdbentryItem, index);\r
+    } //-- void setPdbentryItem(int, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method setPdbentryItem\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param pdbentryItemArray\r
+     */\r
+    public void setPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[] pdbentryItemArray)\r
     {\r
-      validate();\r
-    }\r
-    catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
+        //-- copy array\r
+        _items.removeAllElements();\r
+        for (int i = 0; i < pdbentryItemArray.length; i++) {\r
+            _items.addElement(pdbentryItemArray[i]);\r
+        }\r
+    } //-- void setPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) \r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'type'.\r
+     * \r
+     * @param type the value of field 'type'.\r
+     */\r
+    public void setType(java.lang.String type)\r
     {\r
-      return false;\r
-    }\r
-    return true;\r
-  } //-- boolean isValid()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method marshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param out\r
-   */\r
-  public void marshal(java.io.Writer out)\r
-      throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-\r
-    Marshaller.marshal(this, out);\r
-  } //-- void marshal(java.io.Writer)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method marshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param handler\r
-   */\r
-  public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-      throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-\r
-    Marshaller.marshal(this, handler);\r
-  } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method removeAllPdbentryItem\r
-   *\r
-   */\r
-  public void removeAllPdbentryItem()\r
-  {\r
-    _items.removeAllElements();\r
-  } //-- void removeAllPdbentryItem()\r
-\r
-  /**\r
-   * Method removePdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param index\r
-   * @return PdbentryItem\r
-   */\r
-  public jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem removePdbentryItem(int\r
-      index)\r
-  {\r
-    java.lang.Object obj = _items.elementAt(index);\r
-    _items.removeElementAt(index);\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem) obj;\r
-  } //-- jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem removePdbentryItem(int)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'file'.\r
-   *\r
-   * @param file the value of field 'file'.\r
-   */\r
-  public void setFile(java.lang.String file)\r
-  {\r
-    this._file = file;\r
-  } //-- void setFile(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'id'.\r
-   *\r
-   * @param id the value of field 'id'.\r
-   */\r
-  public void setId(java.lang.String id)\r
-  {\r
-    this._id = id;\r
-  } //-- void setId(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method setPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param index\r
-   * @param vPdbentryItem\r
-   */\r
-  public void setPdbentryItem(int index,\r
-                              jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem\r
-                              vPdbentryItem)\r
-      throws java.lang.IndexOutOfBoundsException\r
-  {\r
-    //-- check bounds for index\r
-    if ( (index < 0) || (index > _items.size()))\r
+        this._type = type;\r
+    } //-- void setType(java.lang.String) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method unmarshal\r
+     * \r
+     * \r
+     * \r
+     * @param reader\r
+     * @return Object\r
+     */\r
+    public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
+        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
     {\r
-      throw new IndexOutOfBoundsException();\r
-    }\r
-    _items.setElementAt(vPdbentryItem, index);\r
-  } //-- void setPdbentryItem(int, jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method setPdbentryItem\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param pdbentryItemArray\r
-   */\r
-  public void setPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem[]\r
-                              pdbentryItemArray)\r
-  {\r
-    //-- copy array\r
-    _items.removeAllElements();\r
-    for (int i = 0; i < pdbentryItemArray.length; i++)\r
+        return (jalview.schemabinding.version2.Pdbentry) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.Pdbentry.class, reader);\r
+    } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
+\r
+    /**\r
+     * Method validate\r
+     * \r
+     */\r
+    public void validate()\r
+        throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
     {\r
-      _items.addElement(pdbentryItemArray[i]);\r
-    }\r
-  } //-- void setPdbentryItem(jalview.schemabinding.version2.PdbentryItem)\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'type'.\r
-   *\r
-   * @param type the value of field 'type'.\r
-   */\r
-  public void setType(java.lang.String type)\r
-  {\r
-    this._type = type;\r
-  } //-- void setType(java.lang.String)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method unmarshal\r
-   *\r
-   *\r
-   *\r
-   * @param reader\r
-   * @return Object\r
-   */\r
-  public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
-      throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-      org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.Pdbentry) Unmarshaller.unmarshal(\r
-        jalview.schemabinding.version2.Pdbentry.class, reader);\r
-  } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader)\r
-\r
-  /**\r
-   * Method validate\r
-   *\r
-   */\r
-  public void validate()\r
-      throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.\r
-        Validator();\r
-    validator.validate(this);\r
-  } //-- void validate()\r
+        org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
+        validator.validate(this);\r
+    } //-- void validate() \r
 \r
 }\r