jalview XML schema update for 2.4.1 (or 2.5?) introducing IDs for views and treepanel...
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / ThresholdLine.java
index 91bdfc6..4e3f124 100755 (executable)
@@ -1,26 +1,15 @@
 /*\r
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)\r
- * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
- * \r
- * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
- * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
- * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
- * of the License, or (at your option) any later version.\r
- * \r
- * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
- * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
- * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
- * GNU General Public License for more details.\r
- * \r
- * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
- * along with this program; if not, write to the Free Software\r
- * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
+ * This class was automatically generated with \r
+ * <a href="http://www.castor.org">Castor 1.1</a>, using an XML\r
+ * Schema.\r
+ * $Id$\r
  */\r
+\r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
-// ---------------------------------/\r
-// - Imported classes and packages -/\r
-// ---------------------------------/\r
+  //---------------------------------/\r
+ //- Imported classes and packages -/\r
+//---------------------------------/\r
 \r
 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
@@ -30,239 +19,223 @@ import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;
  * \r
  * @version $Revision$ $Date$\r
  */\r
-public class ThresholdLine implements java.io.Serializable\r
-{\r
-\r
-  // --------------------------/\r
-  // - Class/Member Variables -/\r
-  // --------------------------/\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _label.\r
-   */\r
-  private java.lang.String _label;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _value.\r
-   */\r
-  private float _value;\r
-\r
-  /**\r
-   * keeps track of state for field: _value\r
-   */\r
-  private boolean _has_value;\r
-\r
-  /**\r
-   * Field _colour.\r
-   */\r
-  private int _colour;\r
-\r
-  /**\r
-   * keeps track of state for field: _colour\r
-   */\r
-  private boolean _has_colour;\r
-\r
-  // ----------------/\r
-  // - Constructors -/\r
-  // ----------------/\r
-\r
-  public ThresholdLine()\r
-  {\r
-    super();\r
-  }\r
-\r
-  // -----------/\r
-  // - Methods -/\r
-  // -----------/\r
-\r
-  /**\r
-   */\r
-  public void deleteColour()\r
-  {\r
-    this._has_colour = false;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   */\r
-  public void deleteValue()\r
-  {\r
-    this._has_value = false;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'colour'.\r
-   * \r
-   * @return the value of field 'Colour'.\r
-   */\r
-  public int getColour()\r
-  {\r
-    return this._colour;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'label'.\r
-   * \r
-   * @return the value of field 'Label'.\r
-   */\r
-  public java.lang.String getLabel()\r
-  {\r
-    return this._label;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Returns the value of field 'value'.\r
-   * \r
-   * @return the value of field 'Value'.\r
-   */\r
-  public float getValue()\r
-  {\r
-    return this._value;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method hasColour.\r
-   * \r
-   * @return true if at least one Colour has been added\r
-   */\r
-  public boolean hasColour()\r
-  {\r
-    return this._has_colour;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method hasValue.\r
-   * \r
-   * @return true if at least one Value has been added\r
-   */\r
-  public boolean hasValue()\r
-  {\r
-    return this._has_value;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method isValid.\r
-   * \r
-   * @return true if this object is valid according to the schema\r
-   */\r
-  public boolean isValid()\r
-  {\r
-    try\r
-    {\r
-      validate();\r
-    } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex)\r
-    {\r
-      return false;\r
+public class ThresholdLine implements java.io.Serializable {\r
+\r
+\r
+      //--------------------------/\r
+     //- Class/Member Variables -/\r
+    //--------------------------/\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _label.\r
+     */\r
+    private java.lang.String _label;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _value.\r
+     */\r
+    private float _value;\r
+\r
+    /**\r
+     * keeps track of state for field: _value\r
+     */\r
+    private boolean _has_value;\r
+\r
+    /**\r
+     * Field _colour.\r
+     */\r
+    private int _colour;\r
+\r
+    /**\r
+     * keeps track of state for field: _colour\r
+     */\r
+    private boolean _has_colour;\r
+\r
+\r
+      //----------------/\r
+     //- Constructors -/\r
+    //----------------/\r
+\r
+    public ThresholdLine() {\r
+        super();\r
+    }\r
+\r
+\r
+      //-----------/\r
+     //- Methods -/\r
+    //-----------/\r
+\r
+    /**\r
+     */\r
+    public void deleteColour(\r
+    ) {\r
+        this._has_colour= false;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     */\r
+    public void deleteValue(\r
+    ) {\r
+        this._has_value= false;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'colour'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Colour'.\r
+     */\r
+    public int getColour(\r
+    ) {\r
+        return this._colour;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'label'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Label'.\r
+     */\r
+    public java.lang.String getLabel(\r
+    ) {\r
+        return this._label;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Returns the value of field 'value'.\r
+     * \r
+     * @return the value of field 'Value'.\r
+     */\r
+    public float getValue(\r
+    ) {\r
+        return this._value;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method hasColour.\r
+     * \r
+     * @return true if at least one Colour has been added\r
+     */\r
+    public boolean hasColour(\r
+    ) {\r
+        return this._has_colour;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method hasValue.\r
+     * \r
+     * @return true if at least one Value has been added\r
+     */\r
+    public boolean hasValue(\r
+    ) {\r
+        return this._has_value;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method isValid.\r
+     * \r
+     * @return true if this object is valid according to the schema\r
+     */\r
+    public boolean isValid(\r
+    ) {\r
+        try {\r
+            validate();\r
+        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+            return false;\r
+        }\r
+        return true;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param out\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final java.io.Writer out)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, out);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @param handler\r
+     * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during\r
+     * marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+    throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        Marshaller.marshal(this, handler);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'colour'.\r
+     * \r
+     * @param colour the value of field 'colour'.\r
+     */\r
+    public void setColour(\r
+            final int colour) {\r
+        this._colour = colour;\r
+        this._has_colour = true;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'label'.\r
+     * \r
+     * @param label the value of field 'label'.\r
+     */\r
+    public void setLabel(\r
+            final java.lang.String label) {\r
+        this._label = label;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Sets the value of field 'value'.\r
+     * \r
+     * @param value the value of field 'value'.\r
+     */\r
+    public void setValue(\r
+            final float value) {\r
+        this._value = value;\r
+        this._has_value = true;\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * Method unmarshal.\r
+     * \r
+     * @param reader\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @return the unmarshaled\r
+     * jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine\r
+     */\r
+    public static jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine unmarshal(\r
+            final java.io.Reader reader)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        return (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class, reader);\r
+    }\r
+\r
+    /**\r
+     * \r
+     * \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void validate(\r
+    )\r
+    throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
+        org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
+        validator.validate(this);\r
     }\r
-    return true;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @param out\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
-   */\r
-  public void marshal(final java.io.Writer out)\r
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    Marshaller.marshal(this, out);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @param handler\r
-   * @throws java.io.IOException\r
-   *                 if an IOException occurs during marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
-   */\r
-  public void marshal(final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-          throws java.io.IOException,\r
-          org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    Marshaller.marshal(this, handler);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'colour'.\r
-   * \r
-   * @param colour\r
-   *                the value of field 'colour'.\r
-   */\r
-  public void setColour(final int colour)\r
-  {\r
-    this._colour = colour;\r
-    this._has_colour = true;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'label'.\r
-   * \r
-   * @param label\r
-   *                the value of field 'label'.\r
-   */\r
-  public void setLabel(final java.lang.String label)\r
-  {\r
-    this._label = label;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Sets the value of field 'value'.\r
-   * \r
-   * @param value\r
-   *                the value of field 'value'.\r
-   */\r
-  public void setValue(final float value)\r
-  {\r
-    this._value = value;\r
-    this._has_value = true;\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * Method unmarshal.\r
-   * \r
-   * @param reader\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException\r
-   *                 if object is null or if any SAXException is thrown during\r
-   *                 marshaling\r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
-   * @return the unmarshaled jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine\r
-   */\r
-  public static jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine unmarshal(\r
-          final java.io.Reader reader)\r
-          throws org.exolab.castor.xml.MarshalException,\r
-          org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    return (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) Unmarshaller\r
-            .unmarshal(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class,\r
-                    reader);\r
-  }\r
-\r
-  /**\r
-   * \r
-   * \r
-   * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-   *                 if this object is an invalid instance according to the\r
-   *                 schema\r
-   */\r
-  public void validate() throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-  {\r
-    org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
-    validator.validate(this);\r
-  }\r
 \r
 }\r