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[jalview.git] / src / jalview / schemes / RNAHelicesColourChooser.java
index 39062e7..5b97a12 100644 (file)
@@ -47,13 +47,14 @@ public class RNAHelicesColourChooser
 
   boolean adjusting = false;
 
-  public RNAHelicesColourChooser(AlignViewportI av, final AlignmentViewPanel ap)
+  public RNAHelicesColourChooser(AlignViewportI av,
+          final AlignmentViewPanel ap)
   {
     oldcs = av.getGlobalColourScheme();
     if (av.getAlignment().getGroups() != null)
     {
       oldgroupColours = new Hashtable();
-      for (SequenceGroup sg:ap.getAlignment().getGroups())
+      for (SequenceGroup sg : ap.getAlignment().getGroups())
       {
         if (sg.cs != null)
         {
@@ -101,12 +102,12 @@ public class RNAHelicesColourChooser
     RNAHelicesColour rhc = null;
 
     rhc = new RNAHelicesColour(currentAnnotation);
-   
+
     av.setGlobalColourScheme(rhc);
 
     if (av.getAlignment().getGroups() != null)
     {
-      for (SequenceGroup sg:ap.getAlignment().getGroups())
+      for (SequenceGroup sg : ap.getAlignment().getGroups())
       {
         if (sg.cs == null)
         {
@@ -126,7 +127,7 @@ public class RNAHelicesColourChooser
     av.setGlobalColourScheme(oldcs);
     if (av.getAlignment().getGroups() != null)
     {
-      for (SequenceGroup sg:ap.getAlignment().getGroups())
+      for (SequenceGroup sg : ap.getAlignment().getGroups())
       {
         sg.cs = (ColourSchemeI) oldgroupColours.get(sg);
       }